MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3084969170 · doi:10.1371/journal.pgen.1008956

Genetic analysis of the modern Australian labradoodle dog breed reveals an excess of the poodle genome

2020· article· en· W3084969170 sur OpenAlexaboutno aff
Muhammad Basil Ali, Jacquelyn M. Evans, Heidi G. Parker, Jaemin Kim, Susan E. Pearce-Kelling, D. Thad Whitaker, Jocelyn Plassais, Qaiser M. Khan, Elaine A. Ostrander

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHuman-Animal Interaction Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Human Genome Research Institute
Mots-clésPurebredBiologyBreedDomesticationPopulationEvolutionary biologyAlleleCoatGeneticsDemographyGeneEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The genomic diversity of the domestic dog is an invaluable resource for advancing understanding of mammalian biology, evolutionary biology, morphologic variation, and behavior. There are approximately 350 recognized breeds in the world today, many established through hybridization and selection followed by intense breeding programs aimed at retaining or enhancing specific traits. As a result, many breeds suffer from an excess of particular diseases, one of many factors leading to the recent trend of "designer breed" development, i.e. crossing purebred dogs from existing breeds in the hope that offspring will be enriched for desired traits and characteristics of the parental breeds. We used a dense panel of 150,106 SNPs to analyze the population structure of the Australian labradoodle (ALBD), to understand how such breeds are developed. Haplotype and admixture analyses show that breeds other than the poodle (POOD) and Labrador retriever (LAB) contributed to ALBD formation, but that the breed is, at the genetic level, predominantly POOD, with all small and large varieties contributing to its construction. Allele frequency analysis reveals that the breed is enhanced for variants associated with a poodle-like coat, which is perceived by breeders to have an association with hypoallergenicity. We observed little enhancement for LAB-specific alleles. This study provides a blueprint for understanding how dog breeds are formed, highlighting the limited scope of desired traits in defining new breeds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,228
Score d'incertitude au seuil0,488

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS GeneticsMême sujetHuman-Animal Interaction StudiesTravaux en français237 207