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Enregistrement W3085256600 · doi:10.1101/gr.270330.120

Corrigendum: Functional annotation of human long noncoding RNAs via molecular phenotyping

2020· erratum· en· W3085256600 sur OpenAlexaff
Jordan A. Ramilowski, Chi Wai Yip, Saumya Agrawal, Jen-Chien Chang, Yari Ciani, Ivan V. Kulakovskiy, Mickaël Mendez, Jasmine Li Ching Ooi, John F. Ouyang, Nick Parkinson, Andreas Petri, Leonie Roos, Jessica Severin, Kayoko Yasuzawa, Imad Abugessaisa, Altuna Akalin, Ivan Antonov, Alessandro Bonetti, Hidemasa Bono, Beatrice Borsari, Frank Brombacher, Christopher J. F. Cameron, Carlo Vittorio Cannistraci, Ryan Cardenas, Mélissa Cardon, Howard Chang, Josée Dostie, Luca Ducoli, Alexander V. Favorov, Alexandre Fort, Diego Garrido-Martín, Noa Gil, Juliette Gimenez, Reto Guler, Lusy Handoko, Jayson Harshbarger, Akira Hasegawa, Yuki Hasegawa, Kosuke Hashimoto, Norihito Hayatsu, Peter Heutink, Tetsuro Hirose, Eddie L. Imada, Masayoshi Itoh, Bogumił Kaczkowski, Aditi Kanhere, Emily Kawabata, Hideya Kawaji, Tsugumi Kawashima, S. Thomas Kelly, Miki Kojima, Naoto Kondo, Haruhiko Koseki, Tsukasa Kouno, Anton Kratz, Mariola Kurowska‐Stolarska, Andrew Tae Jun Kwon, Jeffrey T. Leek, Andreas Lennartsson, Marina Lizio, Fernando Martínez López, Joachim Luginbühl, Shiori Maeda, Vsevolod J. Makeev, Luigi Marchionni, Yulia A. Medvedeva, Aki Minoda, Ferenc Müller, Manuel Muñoz-Aguirre, Mitsuyoshi Murata, Hiromi Nishiyori, Kazuhiro R. Nitta, S. Noguchi, Yukihiko Noro, Ramil Nurtdinov, Yasushi Okazaki, Valerio Orlando, Denis Paquette, Callum Parr, Owen J. L. Rackham, Patrizia Rizzu, Diego F. Sánchez, Albin Sandelin, Sanjana Pillay, Colin A. Semple, Youtaro Shibayama, Divya M. Sivaraman, Takahiro Suzuki, Suzannah C. Szumowski, Michihira Tagami, Martin S. Taylor, Chikashi Terao, Malte Thodberg, Supat Thongjuea, Vidisha Tripathi, Igor Ulitsky, Roberto Verardo, Ilya E. Vorontsov, Chinatsu Yamamoto, Robert S. Young, J. Kenneth Baillie, Alistair R. R. Forrest, Roderic Guigó, Michael M. Hoffman, Chung-Chau Hon, Takeya Kasukawa, Sakari Kauppinen, Juha Kere, Boris Lenhard, Claudio Schneider, Harukazu Suzuki, Ken Yagi, Michiel de Hoon, Jay W. Shin, Piero Carninci

Notice bibliographique

RevueGenome Research · 2020
Typeerratum
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyComputational biologyLong non-coding RNAAnnotationNon-coding RNAGeneticsEvolutionary biologymicroRNAGeneRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The authors would like to correct Figure This correction does not affect any of the conclusions of the article. The corrected image representative of RRAS2-KD-sh769 is provided below, and Figure

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,782
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,076
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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