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Enregistrement W3085423360 · doi:10.3390/microorganisms8091421

Altered Envelope Structure and Nanomechanical Properties of a C-Terminal Protease A-Deficient Rhizobium leguminosarum

2020· article· en· W3085423360 sur OpenAlexafffund
Dong Jun, Ubong R. Idem, Tanya E. S. Dahms

Notice bibliographique

RevueMicroorganisms · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensUniversity of Regina
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Foundation for InnovationFaculty of Graduate Studies and Research, University of ReginaUniversity of Regina
Mots-clésPeptidoglycanCell envelopeBiophysicsBacterial outer membraneViscoelasticityCell wallBacterial cell structureForce spectroscopyMutantMaterials scienceChemistryBiochemistryBiologyAtomic force microscopyNanotechnologyBacteriaComposite material

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

(1) Background: Many factors can impact bacterial mechanical properties, which play an important role in survival and adaptation. This study characterizes the ultrastructural phenotype, elastic and viscoelastic properties of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 and the C-terminal protease A (ctpA) null mutant strain predicted to have a compromised cell envelope; (2) Methods: To probe the cell envelope, we used transmission electron microscopy (TEM), high performance liquid chromatography (HPLC), mass spectrometry (MS), atomic force microscopy (AFM) force spectroscopy, and time-dependent AFM creep deformation; (3) Results: TEM images show a compromised and often detached outer membrane for the ctpA mutant. Muropeptide characterization by HPLC and MS showed an increase in peptidoglycan dimeric peptide (GlcNAc-MurNAc-Ala-Glu-meso-DAP-Ala-meso-DAP-Glu-Ala-MurNAc-GlcNAc) for the ctpA mutant, indicative of increased crosslinking. The ctpA mutant had significantly larger spring constants than wild type under all hydrated conditions, attributable to more highly crosslinked peptidoglycan. Time-dependent AFM creep deformation for both the wild type and ctpA mutant was indicative of a viscoelastic cell envelope, with best fit to the four-element Burgers model and generating values for viscoelastic parameters k1, k2, η1, and η2; (4) Conclusions: The viscoelastic response of the ctpA mutant is consistent with both its compromised outer membrane (TEM) and fortified peptidoglycan layer (HPLC/MS).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,316

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,183
Écart entre enseignants0,164 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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