X chromosome-dependent disruption of placental regulatory networks in hybrid dwarf hamsters
Notice bibliographique
Résumé
Embryonic development in mammals is highly sensitive to changes in gene expression within the placenta. The placenta is also highly enriched for genes showing parent-of-origin or imprinted expression, which is predicted to evolve rapidly in response to parental conflict. However, little is known about the evolution of placental gene expression, or if divergence of placental gene expression plays an important role in mammalian speciation. We used crosses between two species of dwarf hamsters ( Phodopus sungorus and P. campbelli ) to examine the genetic and regulatory underpinnings of severe placental overgrowth in their hybrids. Using quantitative genetic mapping and mitochondrial substitution lines, we show that overgrowth of hybrid placentas was primarily caused by genetic differences on the maternally inherited P. sungorus X chromosome. Mitochondrial interactions did not contribute to abnormal hybrid placental development, and there was only weak correspondence between placental disruption and embryonic growth. Genome-wide analyses of placental transcriptomes from the parental species and first and second-generation hybrids revealed a central group of co-expressed X-linked and autosomal genes that were highly enriched for maternally-biased expression. Expression of this gene network was strongly correlated with placental size and showed widespread misexpression dependent on epistatic interactions with X-linked hybrid incompatibilities. Collectively, our results indicate that the X chromosome is likely to play a prominent role in the evolution of placental gene expression and the accumulation of hybrid developmental barriers between mammalian species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».