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Enregistrement W3085774216 · doi:10.5194/egusphere-egu2020-5855

Iron and manganese colimitation in the Southern Ocean examined with a proteomic allocation model

2020· article· en· W3085774216 sur OpenAlexaff
J. Scott P. McCain, Eric P. Achterberg, Alessandro Tagliabue, Erin M. Bertrand

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal ecosystems
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésManganesePhytoplanktonBiogeochemical cycleProductivityPrimary productivityLimitingFlux (metallurgy)PhotosynthesisDiffusionEnvironmental scienceOceanographyChemistryEnvironmental chemistryNutrientBiologyEcologyGeologyPhysicsThermodynamicsBiochemistryEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Iron (Fe) limits primary productivity in a large part of the ocean; but recent geochemical profiles and bottle incubation assays indicate that manganese (Mn) can also limit primary productivity in the Southern Ocean. Fe and Mn can interact to influence primary productivity, but the extent to which these elements colimit phytoplankton in the Southern Ocean is uncertain. In addition, current models are insufficient to assess colimitation as they assume a single, most scarce, resource. In order to examine Fe and Mn colimitation in phytoplankton, we developed a modeling framework to predict proteomic profiles under varying Fe, Mn, and light conditions. In our model, proteins are optimally allocated to various coarse-grained cellular pools, governed by environmental conditions. We predict that Fe controls cellular Mn quotas, largely because of paired stoichiometry within photosynthetic machinery. Our model suggests that the diffusion-limitation paradigm of Fe should be revisited, as diffusive flux of Fe does not appear to be limiting. We then use our model to explore various cellular mechanisms leading to phytoplankton Fe limitation. Lastly, using Fe and Mn biogeochemical model output, we predict regions in the Southern Ocean where Fe/Mn colimitation is most likely to occur.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,089

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,174
Écart entre enseignants0,157 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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