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Enregistrement W3086624556 · doi:10.1016/j.isci.2020.101552

Exome Sequencing Implicates Impaired GABA Signaling and Neuronal Ion Transport in Trigeminal Neuralgia

2020· article· en· W3086624556 sur OpenAlexafffund
Weilai Dong, Sheng Chih Jin, August Allocco, Xue Zeng, Amar H. Sheth, Shreyas Panchagnula, Annie Castonguay, Louis-Étienne Lorenzo, Barira Islam, Geneviève Brindle, Karine Bachand, Jamie Hu, Agata Sularz, Jonathan Gaillard, Jungmin Choi, Ashley Dunbar, Carol Nelson‐Williams, Emre Kiziltug, Charuta G. Furey, Sierra Conine, Phan Q. Duy, Adam J. Kundishora, Erin Loring, Boyang Li, Qiongshi Lu, Geyu Zhou, Wei Liu, Xinyue Li, Michael C. Sierant, Shrikant Mane, Christopher Castaldi, Francesc López‐Giráldez, James Knight, Raymond F. Sekula, J. Marc Simard, Emad N. Eskandar, Christopher Gottschalk, Jennifer Moliterno, Murat Günel, Jason L. Gerrard, Sulayman D. Dib‐Hajj, Stephen G. Waxman, Fred G. Barker, Seth L. Alper, Mohamed Chahine, Shozeb Haider, Yves De Koninck, Richard P. Lifton, Kristopher T. Kahle

Notice bibliographique

RevueiScience · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTrigeminal Neuralgia and Treatments
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Human Genome Research InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute on AgingNational Institutes of HealthEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentCanada Research ChairsNational Institute of General Medical SciencesAmerican Heart Association
Mots-clésExome sequencingProbandTrigeminal neuralgiaNeuropathic painPathogenesisExomeBiologyGeneticsMutationMedicineNeuroscienceBioinformaticsInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Trigeminal neuralgia (TN) is a common, debilitating neuropathic face pain syndrome often resistant to therapy. The familial clustering of TN cases suggests that genetic factors play a role in disease pathogenesis. However, no unbiased, large-scale genomic study of TN has been performed to date. Analysis of 290 whole exome-sequenced TN probands, including 20 multiplex kindreds and 70 parent-offspring trios, revealed enrichment of rare, damaging variants in GABA receptor-binding genes in cases. Mice engineered with a TN-associated de novo mutation (p.Cys188Trp) in the GABA A receptor Cl − channel γ-1 subunit ( GABRG1 ) exhibited trigeminal mechanical allodynia and face pain behavior. Other TN probands harbored rare damaging variants in Na + and Ca + channels, including a significant variant burden in the α-1H subunit of the voltage-gated Ca 2+ channel Ca v 3.2 ( CACNA1H ). These results provide exome-level insight into TN and implicate genetically encoded impairment of GABA signaling and neuronal ion transport in TN pathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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