MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3086962295 · doi:10.3390/biology9090294

A Poplar Rust Effector Protein Associates with Protein Disulfide Isomerase and Enhances Plant Susceptibility

2020· article· en· W3086962295 sur OpenAlexafffund
Mst Hur Madina, Md. Saifur Rahman, Xiaoqiang Huang, Yang Zhang, Huanquan Zheng, Hugo Germain

Notice bibliographique

RevueBiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversité du Québec à Trois-Rivières
Organismes subventionnairesCanada Research Chairs
Mots-clésBiologyProtein disulfide-isomeraseEffectorRust (programming language)BotanyDisulfide bondPlant proteinBiochemistryFood science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Melampsora larici-populina (Mlp), the causal agent of Populus leaf rust, secretes an array of effectors into the host through the haustorium to gain nutrients and suppress immunity. The precise mechanisms by which these effectors promote virulence remain unclear. To address this question, we developed a transgenic Arabidopsis line expressing a candidate effector, Mlp124357. Constitutive expression of the effector increased plant susceptibility to pathogens. A GxxxG motif present in Mlp124357 is required for its subcellular localization at the vacuolar membrane of the plant cell, as replacement of the glycine residues with alanines led to the delocalization of Mlp124357 to the nucleus and cytoplasm. We used immunoprecipitation and mass spectrometry (MS) to identify Mlp124357 interaction partners. Only one of the putative interaction partners knock-out line caused delocalization of the effector, indicating that Arabidopsis protein disulfide isomerase-11 (AtPDI-11) is required for the effector localization. This interaction was further confirmed by a complementation test, a yeast-two hybrid assay and a molecular modeling experiment. Moreover, localization results and infection assays suggest that AtPDI-11 act as a helper for Mlp124357. In summary, our findings established that one of Mlp effectors resides at the vacuole surface and modulates plant susceptibility.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,318
Score d'incertitude au seuil0,264

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiologyMême sujetPlant-Microbe Interactions and ImmunityTravaux en français237 207