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Enregistrement W3087062906 · doi:10.1101/2020.09.17.20187054

Genome-wide association study of over 40,000 bipolar disorder cases provides new insights into the underlying biology

2020· preprint· en· W3087062906 sur OpenAlexaff
Niamh Mullins, Andreas J. Forstner, Kevin S. O’Connell, Brandon J. Coombes, Jonathan R. I. Coleman, Zhen Qiao, Thomas D. Als, Tim B. Bigdeli, Sigrid Børte, Julien Bryois, Alexander W. Charney, Ole Kristian Drange, Michael J. Gandal, Saskia P. Hagenaars, Masashi Ikeda, Nolan Kamitaki, Minsoo Kim, Kristi Krebs, Georgia Panagiotaropoulou, Brian M. Schilder, Laura Sloofman, Stacy Steinberg, Vassily Trubetskoy, Bendik S. Winsvold, Hong‐Hee Won, Liliya Abramova, Kristina Adorjan, Esben Agerbo, Mariam Al Eissa, Diego Albani, Ney Alliey‐Rodriguez, Adebayo Anjorin, Verneri Antilla, Anastasia Antoniou, Swapnil Awasthi, Ji Hyun Baek, Marie Bækvad‐Hansen, Nicholas Bass, Michael Bauer, Eva C. Beins, Sarah E. Bergen, Armin Birner, Carsten Bøcker Pedersen, Erlend Bøen, Marco P. Boks, Rosa Bosch, Murielle Brum, Ben Brumpton, Nathalie Brunkhorst-Kanaan, Monika Budde, Jonas Bybjerg‐Grauholm, William Byerley, Murray J. Cairns, Miguel Casas, Pablo Cervantes, Toni‐Kim Clarke, Cristiana Cruceanu, Alfredo B. Cuéllar‐Barboza, Julie M. Cunningham, David Curtis, Piotr M. Czerski, Anders M. Dale, Nina Dalkner, Friederike S. David, Franziska Degenhardt, Srdjan Djurovic, Amanda Dobbyn, Athanasios Douzenis, Torbjørn Elvsåshagen, Valentina Escott‐Price, I. Nicol Ferrier, Alessia Fiorentino, Tatiana Foroud, Liz Forty, Josef Frank, Oleksandr Frei, Nelson B. Freimer, Louise Frisén, Katrin Gade, Julie Garnham, Joel Gelernter, Marianne Giørtz Pedersen, Ian R. Gizer, Scott D. Gordon, Katherine Gordon‐Smith, Tiffany A. Greenwood, Jakob Grove, José Guzmán‐Parra, Kyooseob Ha, Magnús Haraldsson, Martin Hautzinger, Urs Heilbronner, Dennis Hellgren, Stefan Herms, Per Hoffmann, Peter Holmans, Laura M. Huckins, Stéphane Jamain, Jessica Johnson, János Kálmán, James L. Kennedy, Sarah Kittel‐Schneider, James A. Knowles, Manolis Kogevinas, Maria Koromina, Thorsten M. Kranz, Henry R. Kranzler, Michiaki Kubo, Ralph Kupka, Steven A. Kushner, Catharina Lavebratt, Jacob Lawrence, Markus Leber, Heon‐Jeong Lee, Phil H. Lee, Shawn Levy, Cathryn M. Lewis, Calwing Liao, Susanne Lucae, Martin Lundberg, Donald J. MacIntyre, Sigurður H. Magnússon, Wolfgang Maier, Adam X. Maihofer, Dolores Malaspina, Eirini Maratou, Lina Martinsson, Manuel Mattheisen, Steven A. McCarroll, Nathaniel W. McGregor, Peter McGuffin, James McKay, Helena Medeiros, Sarah E. Medland, Vincent Millischer, Grant W. Montgomery, Jennifer L. Moran, Derek W. Morris, Thomas W. Mühleisen, Niamh L. O’Brien, Claire O’Donovan, Loes M. Olde Loohuis, Lilijana Oruč, Sergi Papiol, Antonio F. Pardiñas, Amy Perry, Andrea Pfennig, Evgenia Porichi, James B. Potash, Digby Quested, Towfique Raj, Mark Hyman Rapaport, J. Raymond DePaulo, Eline J. Regeer, John P. Rice, Fabio Rivas, Margarita Rivera, Julian Roth, Panos Roussos, Douglas M. Ruderfer, Cristina Sánchez‐Mora, Eva C. Schulte, Fanny Senner, Sally I. Sharp, Paul D. Shilling, Engilbert Sigurðsson, Lea Sirignano, Claire Slaney, Olav B. Smeland, Daniel J. Smıth, Janet L. Sobell, Christine Søholm Hansen, María Soler Artigas, Anne T. Spijker, Dan J. Stein, John S. Strauss, Beata Świątkowska, Chikashi Terao, Thorgeir E. Thorgeirsson, Claudio Toma, Paul A. Tooney, Evangelia Eirini Tsermpini, Marquis P. Vawter, Helmut Vedder, James Walters, Stephanie H. Witt, Simon Xi, Wei Xu, Jessica Yang, Allan H. Young, Hannah Young, Peter P. Zandi, Hang Zhou, Lea Zillich, HUNT All-In Psychiatry, Rolf Adolfsson, Ingrid Agartz, Martin Alda, Lars Alfredsson, Gulja Babadjanova, Lena Backlund, Bernhard T. Baune, Frank Bellivier, Susanne Bengesser, Wade H. Berrettini, Douglas Blackwood, Michael Boehnke, Anders D. Børglum, Gerome Breen, Vaughan J. Carr, Stanley V. Catts, Aiden Corvin, Nicholas Craddock, Udo Dannlowski, Dimitris Dikeos, Tõnu Esko, Bruno Étain, Panagiotis Ferentinos, Mark A. Frye, Janice M. Fullerton, Micha Gawlik, Elliot S. Gershon, Fernando S. Goes, Melissa J. Green, Maria Grigoroiu‐Serbânescu, Joanna Hauser, Frans A. Henskens, Jan Hillert, Kyung Sue Hong, David M. Hougaard, Christina M. Hultman, Kristian Hveem, Nakao Iwata, Assen Jablensky, Ian Jones, Lisa Jones, René S. Kahn, John R. Kelsoe, George Kirov, Mikael Landén, Marion Leboyer, Qingqin S. Li, Jolanta Lissowska, Christine Löchner, Carmel M. Loughland, Nicholas G. Martin, Carol A. Mathews, Fermín Mayoral, Susan L. McElroy, Andrew M. McIntosh, Francis J. McMahon, Ingrid Melle, Patricia T. Michie, Lili Milani, Philip B. Mitchell, Gunnar Morken, Ole Mors, Preben Bo Mortensen, Bryan Mowry, Bertram Müller-Myhsok, R Myers, Benjamin M. Neale, Caroline M. Nievergelt, Merete Nordentoft, Markus M. Nöthen, Michael O‘Donovan, Ketil J. Øedegaard, Tomas Olsson, Michael J. Owen, Sara A. Paciga, Christos Pantelis, Carlos N. Pato, Michele T. Pato, George P. Patrinos, Roy H. Perlis, Daniëlle Posthuma, Josep Antoni Ramos‐Quiroga, Andreas Reif, Eva Z. Reininghaus, Marta Ribasés, Marcella Rietschel, Stephan Ripke, Guy A. Rouleau, Takeo Saito, Ulrich Schall, Martin Schalling, Peter R. Schofield, Thomas G. Schulze, Laura J. Scott, Rodney J. Scott, Alessandro Serretti, Cynthia Shannon Weickert, Jordan W. Smoller, Hreinn Stefánsson, Eystein Stordal, Fabian Streit, Patrick F. Sullivan, Gustavo Turecki, Eduard Vieta, John B. Vincent, Irwin D. Waldman, Thomas W. Weickert, Thomas Werge, Naomi R. Wray, John‐Anker Zwart, Joanna M. Biernacka, John I. Nürnberger, Sven Cichon, Howard J. Edenberg, Eli A. Stahl, Andrew McQuillin, Arianna Di Florio, Roel A. Ophoff, Ole A. Andreassen

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBipolar Disorder and Treatment
Établissements canadiensPublic Health OntarioMcGill UniversityDalhousie UniversityMontreal Neurological Institute and HospitalUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental HealthMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental Health
Mots-clésGenome-wide association studyBiologyBipolar disorderGeneGeneticsDruggabilityGenetic associationPrefrontal cortexExpression quantitative trait lociNeuroscienceSingle-nucleotide polymorphismGenotypeCognition

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Bipolar disorder (BD) is a heritable mental illness with complex etiology. We performed a genome-wide association study (GWAS) of 41,917 BD cases and 371,549 controls of European ancestry, which identified 64 associated genomic loci. BD risk alleles were enriched in genes in synaptic signaling pathways and brain-expressed genes, particularly those with high specificity of expression in neurons of the prefrontal cortex and hippocampus. Significant signal enrichment was found in genes encoding targets of antipsychotics, calcium channel blockers, antiepileptics and anesthetics. Integrating eQTL data implicated 15 genes robustly linked to BD via gene expression, encoding druggable targets such as HTR6, MCHR1, DCLK3 and FURIN. Analyses of BD subtypes indicated high but imperfect genetic correlation between BD type I and II and identified additional associated loci. Together, these results advance our understanding of the biological etiology of BD, identify novel therapeutic leads and prioritize genes for functional follow-up studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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