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Enregistrement W3087202197 · doi:10.1161/atvbaha.119.313885

A Novel Recurrent <i>COL5A1</i> Genetic Variant Is Associated With a Dysplasia-Associated Arterial Disease Exhibiting Dissections and Fibromuscular Dysplasia

2020· article· en· W3087202197 sur OpenAlexaff
Julie Richer, Hannah Hill, Yu Wang, Min‐Lee Yang, Kristina L. Hunker, Jamie Lane, Susan Blackburn, Dawn M. Coleman, Jonathan L. Eliason, Guillaume Sillon, Daniela D’Agostino, Prasad Jetty, François‐Pierre Mongeon, Anne‐Marie Laberge, Stephen E. Ryan, Natalia Fendrikova-Mahlay, Thais Coutinho, Michael R. Mathis, Matthew Zawistowski, Stanley L. Hazen, Alexander Katz, Heather L. Gornik, Chad M. Brummett, Gonçalo R. Abecasis, Ingrid L. Bergin, James C. Stanley, Jun Z. Li, Santhi K. Ganesh

Notice bibliographique

RevueArteriosclerosis Thrombosis and Vascular Biology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensSt. Stephen's UniversityCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineMontreal Heart InstituteUniversity of OttawaMcGill Genome CentreMcGill UniversityChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesUniversity of MichiganNational Heart, Lung, and Blood InstituteDoris Duke Charitable Foundation
Mots-clésProbandEhlers–Danlos syndromeFibromuscular dysplasiaHaplotypeArterial dissectionMedicineIn silicoCohortExome sequencingPhenotypePathologyInternal medicineGeneticsGastroenterologyGenotypeBiologyGeneDissection (medical)RadiologyMutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: While rare variants in the COL5A1 gene have been associated with classical Ehlers-Danlos syndrome and rarely with arterial dissections, recurrent variants in COL5A1 underlying a systemic arteriopathy have not been described. Monogenic forms of multifocal fibromuscular dysplasia (mFMD) have not been previously defined. Approach and Results: We studied 4 independent probands with the COL5A1 pathogenic variant c.1540G&gt;A, p.(Gly514Ser) who presented with arterial aneurysms, dissections, tortuosity, and mFMD affecting multiple arteries. Arterial medial fibroplasia and smooth muscle cell disorganization were confirmed histologically. The COL5A1 c.1540G&gt;A variant is predicted to be pathogenic in silico and absent in gnomAD. The c.1540G&gt;A variant is on a shared 160.1 kb haplotype with 0.4% frequency in Europeans. Furthermore, exome sequencing data from a cohort of 264 individuals with mFMD were examined for COL5A1 variants. In this mFMD cohort, COL5A1 c.1540G&gt;A and 6 additional relatively rare COL5A1 variants predicted to be deleterious in silico were identified and were associated with arterial dissections ( P =0.005). Conclusions: COL5A1 c.1540G&gt;A is the first recurring variant recognized to be associated with arterial dissections and mFMD. This variant presents with a phenotype reminiscent of vascular Ehlers-Danlos syndrome. A shared haplotype among probands supports the existence of a common founder. Relatively rare COL5A1 genetic variants predicted to be deleterious by in silico analysis were identified in ≈2.7% of mFMD cases, and as they were enriched in patients with arterial dissections, may act as disease modifiers. Molecular testing for COL5A1 should be considered in patients with a phenotype overlapping with vascular Ehlers-Danlos syndrome and mFMD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,884
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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