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Enregistrement W3087460427 · doi:10.1387/ijdb.200233lc

The levels of reprogramming factors influence the induction and maintenance of pluripotency: the case of CD1 mouse strain cells

2020· article· en· W3087460427 sur OpenAlexaff
Luis Covarrubias, José-Ángel Martínez-Sarmiento, C. Valencia, András Nagy, David Hernández-García

Notice bibliographique

RevueThe International Journal of Developmental Biology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesDirección General de Asuntos del Personal Académico, Universidad Nacional Autónoma de MéxicoConsejo Nacional de Ciencia y Tecnología
Mots-clésReprogrammingInduced pluripotent stem cellHomeobox protein NANOGSOX2BiologyRex1KLF4Embryonic stem cellCell biologyMolecular biologyCellGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The amount of proteins of the regulatory pluripotency network can be determinant for somatic cell reprogramming into induced pluripotent stem cells (iPSCs) as well as for the maintenance of pluripotent stem cells (PSCs). Here, we report a transposon-based reprogramming system (PB-Booster) that allowed high expression levels of a polycistronic transgene containing Myc, K lf4, O ct4 and Sox2 ( MKOS ) and showed increased reprogramming efficiency of fresh mouse embryonic fibroblasts (MEFs) into iPSCs under low, but not under high, MKOS expression levels. In contrast, MEFs after 2 passages derived into a similar number of iPSC colonies as fresh MEFs at a high MKOS dose, but this number was reduced at a low MKOS dose. Timing of reprogramming was not affected by MKOS expression levels but, importantly, exogenous MKOS expression in established PSCs caused a significant cell loss. At high but not at low MKOS expression levels, MEFs of the CD1 strain produced more initial cell clusters than iPSCs and, although reprogrammed at a similar efficiency as MEFs of the 129/Sv strain, iPSCs could not be maintained in the absence of exogenous MKOS . In CD1-iPSCs, Oct4 , Nanog , Rex1 and Esrrb expression levels were reduced when compared with the levels in PSCs derived from the 129/Sv strain. Culture of CD1-iPSCs in medium with MEK and GSK3β inhibitors allowed their self-renewal in the absence of exogenous MKOS , but the expression levels of Oct4 , Nanog , Rex1 and Esrrb were only partially increased. Despite the reduced levels of those pluripotency factors, CD1-iPSC kept high capacity for contribution to chimeric mouse embryos. Therefore, levels of regulatory pluripotency factors influence reprogramming initiation and PSC maintenance in vitro without affecting their differentiation potential in vivo .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,238

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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