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Enregistrement W3087560109 · doi:10.1016/j.nicl.2020.102437

A Bayesian 2D functional linear model for gray-level co-occurrence matrices in texture analysis of lower grade gliomas

2020· article· en· W3087560109 sur OpenAlexafffund
Thierry Chekouo, Shariq Mohammed, Arvind Rao

Notice bibliographique

RevueNeuroImage Clinical · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of MichiganAmerican Cancer Society
Mots-clésGray levelBayesian probabilityArtificial intelligenceComputer scienceRadiomicsPattern recognition (psychology)StatisticsIsocitrate dehydrogenaseRealization (probability)MathematicsImage (mathematics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In cancer radiomics, textural features evaluated from image intensity-derived gray-level co-occurrence matrices (GLCMs) have been studied to evaluate gray-level spatial dependence within the regions of interest in the brain. Most of these analysis work with summary statistics (or texture-based features) constructed using the GLCM entries, and potentially overlook other structural properties in the GLCM. In our proposed Bayesian framework, we treat each GLCM as a realization of a two-dimensional stochastic functional process observed with error at discrete time points. The latent process is then combined with the outcome model to evaluate the prediction performance. We use simulation studies to assess the performance of our method and apply it to data collected from individuals with lower grade gliomas. We found our approach to outperform competing methods that use only summary statistics to predict isocitrate dehydrogenase (IDH) mutation status.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,864
Score d'incertitude au seuil0,664

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,127
Tête enseignante GPT0,415
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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