The Duffy-null genotype and risk of infection
Notice bibliographique
Résumé
Many medical treatments, from oncology to psychiatry, can lower white blood cell counts and thus access to these treatments can be restricted to individuals with normal levels of white blood cells, principally in order to minimize risk of serious infection. This adversely affects individuals of African or Middle Eastern ancestries who have on average a reduced number of circulating white blood cells, because of the Duffy-null (CC) genotype at rs2814778 in the ACKR1 gene. Here, we investigate whether the Duffy-null genotype is associated with the risk of infection using the UK Biobank sample and the iPSYCH Danish case-cohort study, two population-based samples from different countries and age ranges. We found that a high proportion of those with the Duffy-null genotype (21%) had a neutrophil count below the threshold often used as a cut-off for access to relevant treatments, compared with 1% of those with the TC/TT genotype. In addition we found that despite its strong association with lower average neutrophil counts, the Duffy-null genotype was not associated with an increased risk of infection, viral or bacterial. These results have widespread implications for the clinical treatment of individuals of African ancestry and indicate that neutrophil thresholds to access treatments could be lowered in individuals with the Duffy-null genotype without an increased risk of infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».