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Enregistrement W3087631144 · doi:10.1093/hmg/ddaa208

The Duffy-null genotype and risk of infection

2020· article· en· W3087631144 sur OpenAlex
Sophie E. Legge, Rune Haubo Bojesen Christensen, Liselotte Petersen, Antonio F. Pardiñas, Matthew Bracher‐Smith, Steven Knapper, Jonas Bybjerg‐Grauholm, Marie Bækvad‐Hansen, David M. Hougaard, Thomas Werge, Merete Nordentoft, Preben Bo Mortensen, Michael J. Owen, Michael O‘Donovan, Michael E. Benros, James Walters

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood groups and transfusion
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthDanmarks Frie ForskningsfondH. Lundbeck A/SSimons FoundationHealth and Care Research WalesLundbeckfondenMedical Research CouncilCardiff UniversityBritish Heart FoundationSimons Foundation Autism Research InitiativeStanley FoundationNational Institute for Health and Care ResearchMedical Research Council Canada
Mots-clésGenotypeBiologyNull allelePopulationImmunologyWhite blood cellAlleleGeneticsDemographyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many medical treatments, from oncology to psychiatry, can lower white blood cell counts and thus access to these treatments can be restricted to individuals with normal levels of white blood cells, principally in order to minimize risk of serious infection. This adversely affects individuals of African or Middle Eastern ancestries who have on average a reduced number of circulating white blood cells, because of the Duffy-null (CC) genotype at rs2814778 in the ACKR1 gene. Here, we investigate whether the Duffy-null genotype is associated with the risk of infection using the UK Biobank sample and the iPSYCH Danish case-cohort study, two population-based samples from different countries and age ranges. We found that a high proportion of those with the Duffy-null genotype (21%) had a neutrophil count below the threshold often used as a cut-off for access to relevant treatments, compared with 1% of those with the TC/TT genotype. In addition we found that despite its strong association with lower average neutrophil counts, the Duffy-null genotype was not associated with an increased risk of infection, viral or bacterial. These results have widespread implications for the clinical treatment of individuals of African ancestry and indicate that neutrophil thresholds to access treatments could be lowered in individuals with the Duffy-null genotype without an increased risk of infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,673
Score d'incertitude au seuil0,190

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle