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Enregistrement W3087678480 · doi:10.1002/mds.28289

Expanding Data Collection for the <scp>MDSGene</scp> Database: X‐linked Dystonia‐Parkinsonism as Use Case Example

2020· review· en· W3087678480 sur OpenAlexaff
Martje G. Pauly, Marta Ruiz López, Ana Westenberger, Gerard Saranza, Norbert Brüggemann, Anne Weißbach, Raymond L. Rosales, Cid Czarina E. Diesta, Roland Dominic G. Jamora, Charles Jourdan Reyes, Harutyun Madoev, Sonja Petkovic, Laurie J. Ozelius, Christine Klein, Aloysius Domingo

Notice bibliographique

RevueMovement Disorders · 2020
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurological disorders and treatments
Établissements canadiensToronto Western Hospital
Organismes subventionnairesDeutsche ForschungsgemeinschaftInternational Parkinson and Movement Disorder Society
Mots-clésParkinsonismCohortMovement disordersDystoniaDatabaseGenetic dataMedicineEssential tremorInformation retrievalPhysical medicine and rehabilitationComputer sciencePsychiatryPathologyDiseasePopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MDSGene is an online database on movement disorders that collates genetic and clinical knowledge using a standardized published literature abstraction strategy. This review is dedicated to X-linked dystonia-parkinsonism (XDP). We screened 233 citations and curated phenotypic and genotypic data for 414 cases. To reduce data missingness, we (1) contacted authors and engaged the research community to provide additional clinical and genetic information, and (2) revisited previously unpublished data from a cohort of XDP patients seen at our institution. Using these approaches, we expanded the cohort to 577 cases and increased information available for important clinical and genetic features such as age at onset, initial manifestation, predominant motor symptoms, functional impairments, and repeat size information. We established the use of mining unpublished data to expand the MDSGene workflow and present an up-to-date description of the phenomenology of XDP using an extensive collection of previously reported and unreported data. © 2020 The Authors. Movement Disorders published by Wiley Periodicals LLC on behalf of International Parkinson and Movement Disorder Society.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,838
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,181
Tête enseignante GPT0,377
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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