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Enregistrement W3088219274 · doi:10.1111/apt.16083

Evaluating the optimum number of biopsies to assess histological inflammation in ulcerative colitis: a retrospective cohort study

2020· article· en· W3088219274 sur OpenAlexaff
Robert Battat, Niels Vande Casteele, Rish K. Pai, Zhongya Wang, Guangyong Zou, John WD McDonald, Marjolijn Duijvestein, Jenny Jeyarajah, Claire E. Parker, Tanja van Viegen, Sigrid Nelson, Brigid S. Boland, Siddharth Singh, Parambir S. Dulai, Mark A. Valasek, Brian G. Feagan, Vipul Jairath, William J. Sandborn

Notice bibliographique

RevueAlimentary Pharmacology & Therapeutics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensWestern UniversityRobarts Clinical Trials
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesCrohn's and Colitis FoundationAmerican Gastroenterological Association
Mots-clésMedicineBiopsyUlcerative colitisHistopathologyConfidence intervalSampling (signal processing)Internal medicineGastroenterologyProspective cohort studyRadiologyPathologyDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The optimal ulcerative colitis biopsy protocol is unclear. AIM: To evaluate the number of biopsies required to accurately assess microscopic disease activity in ulcerative colitis METHODS: Biopsies from patients with ≥4 rectosigmoid samples, and clinical and endoscopic data, were retrospectively obtained from a prospective biobank. Histology and endoscopic videos were read blindly. A 4-biopsy Robarts Histopathology Index (RHI) reference score, consisting of the worst item-level ratings from four biopsies, was compared to 1-, 2- and 3-biopsy estimates. Agreement was determined using bivariate errors-in-variable regression analysis (acceptance interval: ±8.25). Endoscopic activity and disease location subgroup analyses were also performed. RESULTS: Forty-six patients had ≥4 rectosigmoid biopsies available (N = 287). The 2-biopsy (tolerance interval: -7.66, 4.79) and 3-biopsy (tolerance interval: -4.86, 3.46) RHI scores demonstrated acceptable agreement with 4-biopsy scores. One-biopsy scores demonstrated unacceptable agreement (tolerance interval: -13.99, 7.78). Mean RHI scores using the 2-, 3- and 4-biopsy approaches were similar (6.1 ± 9.6 P = 0.36; 6.8 ± 10.5, P = 0.7; 7.5 ± 11.2), whereas the 1-biopsy estimate was lower (4.4 ± 8.1, P = 0.06). Histological remission rates were identical for the 2-, 3- and 4-biopsy methods (65.2%, P = 1.0). Subgroup analysis demonstrated that three biopsies were required in patients with endoscopically active disease. Sampling additional colonic locations yielded lower histological remission rates compared to rectosigmoid sampling alone (33.3% vs 61.9%, P = 0.1). CONCLUSIONS: A minimum of two - conservatively, three - biopsies are required to reliably assess disease activity in a single colonic segment using the RHI. Further studies are needed of endoscopically active patients and sampling locations. These results have implications for biopsy strategies in clinical trials and practice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,015
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,046

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,015
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,392
Écart entre enseignants0,327 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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