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Enregistrement W3088328010 · doi:10.1101/2020.09.27.315622

Genetic variation in <i>CSMD1</i> affects amygdala connectivity and prosocial behavior

2020· preprint· en· W3088328010 sur OpenAlexaff
KC Bickart, Valerio Napolioni, RR Khan, Y Kim, André Altmann, Jonas Richiardi, Megan Newsom, Sepideh Sadaghiani, Tobias Banaschewski, Alw Bokde, EB Quinlan, Sylvane Desrivières, Herta Flor, Hugh Garavan, Penny Gowland, Andreas Heinz, Bernd Ittermann, J. L. Martinot, M-L Paillère Martinot, Éric Artiges, Frauke Nees, Dimitri Papadopoulos Orfanos, Tomáš Paus, Luise Poustka, JH Fröhner, Michael N. Smolka, Henrik Walter, Robert Whelan, Günter Schumann, Bernard Ng, MD Greicius

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaHolland Bloorview Kids Rehabilitation HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilNational Institutes of HealthVetenskapsrådetFondation pour la Recherche MédicaleSvenska Forskningsrådet FormasEU Joint Programme – Neurodegenerative Disease ResearchInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleAgence Nationale de la RechercheMission Interministérielle de Lutte Contre les Drogues et les Conduites AddictivesEli Lilly and CompanyScience Foundation IrelandEuropean CommissionDeutsche ForschungsgemeinschaftKing's College LondonFondation de FranceBundesministerium für Bildung und ForschungNational Institute for Health and Care ResearchSouth London and Maudsley NHS Foundation Trust
Mots-clésAmygdalaEndophenotypeProsocial behaviorNeuroscienceGenome-wide association studyPsychologyAutismBiologyGeneticsDevelopmental psychologyCognitionSingle-nucleotide polymorphismGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The amygdala is one of the most widely connected structures in the primate brain and plays a key role in social and emotional behavior. Here, we present the first genome-wide association study (GWAS) of whole-brain resting-state amygdala networks to discern whether connectivity in these networks could serve as an endophenotype for social behavior. Leveraging published resting-state amygdala networks as a priori endophenotypes in a GWAS meta-analysis of two adolescent cohorts, we identified a common polymorphism on chr.8p23.2 (rs10105357 A/G, MAF (G)=0.35) associated with stronger connectivity in the medial amygdala network (beta=0.20, p =2.97×10 −8 ). This network contains regions that support reward processes and affiliative behavior. People carrying two copies of the minor allele for rs10105357 participate in more prosocial behaviors (t=2.644, p =0.008) and have higher CSMD1 expression in the temporal cortex (t=3.281, p=0.002) than people with one or no copy of the allele. In post-mortem brains across the lifespan, we found that CSMD1 expression is relatively high in the amygdala (2.79 fold higher than white matter, p =1.80×10 −29 ), particularly so for nuclei in the medial amygdala, reaching a maximum in later stages of development. Amygdala network endophenotyping has the potential to accelerate genetic discovery in disorders of social function, such as autism, in which CSMD1 may serve as a diagnostic and therapeutic target.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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