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Enregistrement W3088536766 · doi:10.1242/jcs.248310

UV damage induces G3BP1-dependent stress granule formation that is not driven by mTOR inhibition-mediated translation arrest

2020· article· en· W3088536766 sur OpenAlexafffund
Shan Ying, Denys A. Khaperskyy

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésStress granuleBiologyCell biologyEIF4ETranscription preinitiation complexTranslation (biology)Initiation factorPI3K/AKT/mTOR pathwaySignal transductionMessenger RNABiochemistryGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Translation arrest is a part of the cellular stress response that decreases energy consumption and enables rapid reprioritisation of gene expression. Often translation arrest leads to condensation of untranslated messenger ribonucleoproteins (mRNPs) into stress granules (SGs). Studies into mechanisms of SG formation and functions are complicated because various types of stress cause formation of SGs with different properties and composition. In this work, we focused on the mechanism of SG formation triggered by UV damage. We demonstrate that UV-induced inhibition of translation does not involve inhibition of the mechanistic target of rapamycin (mTOR) signaling or dissociation of the 48S preinitiation complexes. The general control non-derepressible 2 (GCN2; also known as EIF2AK4) kinase contributes to UV-induced SG formation, which is independent of the phosphorylation of the eukaryotic translation initiation factor 2α. Like many other types of SGs, condensation of UV-induced granules requires the Ras-GTPase-activating protein SH3-domain-binding protein 1 (G3BP1). Our work reveals that, in UV-treated cells, the mechanisms of translation arrest and SG formation may be unlinked, resulting in SGs that do not contain the major type of polysome-free preinitiation complexes that accumulate in the cytoplasm.This article has an associated First Person interview with the first author of the paper.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,249

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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