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Enregistrement W3088833208 · doi:10.1101/2020.09.28.313866

No evidence of <i>Toxoplasma gondii</i> infection in urban and rural squirrels

2020· preprint· en· W3088833208 sur OpenAlexaffabout

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueToxoplasma gondii Research Studies
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRodentWildlifeSciurusFecesSciurus carolinensisUrban environmentParasite hosting

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Wildlife in cities can act as reservoirs for parasites that can infect domestic pets and have implications for human health. For example, the Coccidian parasite Toxoplasma gondii can infect all mammalian species, with felids acting as the only definitive hosts. Rodents, such as squirrels, could play an important role in urban infection dynamics of T. gondii , as squirrels occur at higher densities in cities than in natural environments and regularly share their territories with cats. In urban and suburban areas squirrels can encounter infectious oocysts shed in cat feces in contaminated soil or in the food they eat. They are also preyed upon by cats making them a potentially important species for completing the T. gondii life cycle in cities. We hypothesized that due to increased exposure to cats, urban squirrels would be more susceptible to T. gondii infection relative to squirrels in more natural areas. We investigated this using molecular and serological methods on samples collected from American red squirrels ( Tamiasciurus hudsonicus ), eastern grey squirrels ( Sciurus carolinensis ), northern flying squirrels ( Glaucomys sabrinus ), and least chipmunks ( Tamias minimus ) in and around the city of Winnipeg, Manitoba, Canada. We tested a total of 230 tissue samples from 46 squirrels for T. gondii DNA using quantitative PCR and supplemented these data with analyses of 13 serum samples from grey squirrels ( Sciurus carolinensis ) testing for T. gondii antibodies by indirect ELISA. We found no evidence of T. gondii infection in any squirrel. This suggests that squirrels may not be important intermediate hosts of T. gondii in cities and do not need to be considered as sources of infection to cats.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,292
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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