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Enregistrement W3089048326 · doi:10.1002/tbio.202000019

Data consistency and classification model transferability across biomedical Raman spectroscopy systems

2020· article· en· W3089048326 sur OpenAlexafffund
Fabien Picot, François Daoust, Guillaume Sheehy, F. Dallaire, Layal Chaikho, Théophile Bégin, Samuel Kadoury, Frédéric Leblond

Notice bibliographique

RevueTranslational Biophotonics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSpectroscopy Techniques in Biomedical and Chemical Research
Établissements canadiensPolytechnique MontréalCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversité Laval
Mots-clésStandardizationRaman spectroscopyTransferabilityComputer scienceImaging phantomArtificial intelligenceConsistency (knowledge bases)Data miningMedical physicsMachine learningNuclear medicineOpticsMedicinePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Surgical guidance applications using Raman spectroscopy are being developed at a rapid pace in oncology to ensure safe and complete tumor resection during surgery. Clinical translation of these approaches relies on the acquisition of large spectral and histopathological data sets to train classification models. Data calibration must ensure compatibility across Raman systems and predictive model transferability to allow multi‐centric studies to be conducted. This paper addresses issues relating to Raman measurement standardization by first comparing Raman spectral measurements made on an optical phantom and acquired with nine distinct point probe systems and one wide‐field imaging instrument. Data standardization method led to normalized root‐mean‐square deviations between instruments of 2%. A classification model discriminating between white and gray matter was trained with one point probe system. When used to classify independent data sets acquired with the other systems, model predictions led to >95% accuracy, preliminarily demonstrating model transferability across different biomedical Raman spectroscopy instruments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,742
Score d'incertitude au seuil0,620

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,373
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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