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Enregistrement W3089395269 · doi:10.1177/0967033520950516

Predicting terpene content in dried conifer shoots using near infrared spectroscopy

2020· article· en· W3089395269 sur OpenAlexaff
Émilie Champagne, Michael A. Bonin, Alejandro A. Royo, Jean‐Pierre Tremblay, Patricia Raymond

Notice bibliographique

RevueJournal of Near Infrared Spectroscopy · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEssential Oils and Antimicrobial Activity
Établissements canadiensUniversité LavalMinistère des Ressources naturelles et des Forêts
Organismes subventionnairesNorthern Research Station
Mots-clésTerpeneMyrceneChemistryGas chromatographyEssential oilBotanyChromatographyLimoneneBiologyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Terpenes are phytochemicals found in multiple plant genera, especially aromatic herbs and conifers. Terpene content quantification is costly and complex, requiring the extraction of oil content and gas chromatography analyses. Near infrared (NIR) spectroscopy could provide an alternative quantitative method, especially if calibration can be developed with the spectra of dried plant material, which are easier and faster to acquire than oil-based spectra. Here, multispecies NIR spectroscopy calibrations were developed for total terpene content (mono- and sesquiterpenes) and for specific terpenes (α-pinene, β-pinene and myrcene) with five conifers species ( Picea glauca, Picea rubens, Pinus resinosa, Pinus strobus and Thuja occidentalis). The terpene content of fresh shoot samples was quantified with gas chromatography. The NIR spectra were measured on freeze-dried samples (n = 137). Using a subset of the samples, modified partial least squares regressions of total terpene and the three individual terpenes content were generated as a functions of the NIR spectra. The standard errors of the internal cross-validations (values between 0.25 and 2.28) and the ratio of prediction to deviation ratios (RPD values between 2.20 and 2.38) indicate that all calibrations have similar accuracy. The independent validations, however, suggest that the calibrations for total terpene and α-pinene content are more accurate (respective coefficient of determination: r 2 = 0.85 and 0.82). In contrast, calibrations for β-pinene and myrcene had a low accuracy (respectively: r 2 = 0.62 and 0.08), potentially because of the low concentration of these terpenes in the species studied. The calibration model fits (i.e., r 2 ) are comparable to previously published calibration using the spectra of dried shoot samples and demonstrate the potential of this method for terpenes in conifer samples. The calibration method used could be useful in several other domains (e.g. seedling breeding program, industrial), because of the wide distribution of terpenes and especially of pinenes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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