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Enregistrement W3089946243 · doi:10.1074/jbc.ra120.014704

Genetic evidence for partial redundancy between the arginine methyltransferases CARM1 and PRMT6

2020· article· en· W3089946243 sur OpenAlexafffund
Donghang Cheng, Guozhen Gao, Alessandra Di Lorenzo, Sandrine Jayne, Michael O. Hottiger, Stéphane Richard, Mark T. Bedford

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute of General Medical SciencesGovernment of CanadaCancer Prevention and Research Institute of Texas
Mots-clésMethyltransferaseArginineRedundancy (engineering)ChemistryBiochemistryGeneticsBiologyMethylationComputer scienceAmino acidGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CARM1 is a protein arginine methyltransferase (PRMT) that acts as a coactivator in a number of transcriptional programs. CARM1 orchestrates this coactivator activity in part by depositing the H3R17me2a histone mark in the vicinity of gene promoters that it regulates. However, the gross levels of H3R17me2a in CARM1 KO mice did not significantly decrease, indicating that other PRMT(s) may compensate for this loss. We thus performed a screen of type I PRMTs, which revealed that PRMT6 can also deposit the H3R17me2a mark in vitro . CARM1 knockout mice are perinatally lethal and display a reduced fetal size, whereas PRMT6 null mice are viable, which permits the generation of double knockouts. Embryos that are null for both CARM1 and PRMT6 are noticeably smaller than CARM1 null embryos, providing in vivo evidence of redundancy. Mouse embryonic fibroblasts (MEFs) from the double knockout embryos display an absence of the H3R17me2a mark during mitosis and increased signs of DNA damage. Moreover, using the combination of CARM1 and PRMT6 inhibitors suppresses the cell proliferation of WT MEFs, suggesting a synergistic effect between CARM1 and PRMT6 inhibitions. These studies provide direct evidence that PRMT6 also deposits the H3R17me2a mark and acts redundantly with CARM1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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