Alternative Splicing of Opioid Receptor Genes Shows a Conserved Pattern for 6TM Receptor Variants
Notice bibliographique
Résumé
The opioid receptor (OPR) family comprises the mu-, delta-, and kappa-opioid, and nociceptin receptors that belong to the superfamily of 7-transmembrane spanning G protein-coupled receptors (GPCRs). The mu-opioid receptor is the main target for clinically used opioid analgesics, and its biology has been extensively studied. The N-terminally truncated 6TM receptors isoform produced through alternative splicing of the OPRM1 gene displays unique signaling and analgesic properties, but it is unclear if other OPRs have the same ability. In this study, we have built a comprehensive map of alternative splicing events that produce 6TM receptor variants in all the OPRs and demonstrated their evolutionary conservation. We then obtained evidence for their translation through ribosomal footprint analysis. We discovered that N-terminally truncated 6TM GPCRs are rare in the human genome and OPRs are overrepresented in this group. Finally, we also observed a significant enrichment of 6TM GPCR genes among genes associated with pain, psychiatric disorders, and addiction. Understanding the biology of 6TM receptors and leveraging this knowledge for drug development should pave the way for novel therapies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».