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Enregistrement W3090068148 · doi:10.1101/2020.09.30.318626

Bacterial glycocalyx integrity drives multicellular swarm biofilm dynamism

2020· preprint· en· W3090068148 sur OpenAlexafffund
Fares Saïdi, Nicolas Y. Jolivet, David J. Lemon, Arnaldo Nakamura, Anthony G. Garza, Frédéric J. Veyrier, Salim T. Islam

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensUniversité LavalPROTEOInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaBanting Research Foundation
Mots-clésGlycocalyxMyxococcus xanthusBiofilmPilusMulticellular organismCell biologySecretionBiologyCellMotilityMicrobiologySwarm behaviourChemistryBacteriaBiochemistryVirulenceGeneEcologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Bacterial surface exopolysaccharide (EPS) layers are key determinants of biofilm establishment and maintenance, leading to the formation of higher-order 3D structures conferring numerous survival benefits to a cell community. In addition to a specific EPS glycocalyx, we recently revealed that the social δ-proteobacterium Myxococcus xanthus secretes a novel biosurfactant polysaccharide (BPS), with both EPS and BPS polymers required for type IV pilus (T4P)-dependent swarm expansion via spatio-specific biofilm expression profiles. Thus the synergy between EPS and BPS secretion somehow modulates the multicellular lifecycle of M. xanthus . Herein, we demonstrate that BPS secretion functionally-activates the EPS glycocalyx via its destabilization, fundamentally altering the characteristics of the cell surface. This impacts motility behaviours at the single-cell level as well as the aggregative capacity of cells in groups via EPS fibril formation and T4P assembly. These changes modulate structuration of swarm biofilms via cell layering, likely contributing to the formation of internal swarm polysaccharide architecture. Together, these data reveal the manner by which the interplay between two secreted polymers induces single-cell changes that modulate swarm biofilm communities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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