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Enregistrement W3090226203 · doi:10.5194/gmd-2020-158

Development and performance optimization of a parallelcomputing infrastructure for an unstructured-meshmodelling framework

2020· article· en· W3090226203 sur OpenAlexaboutno aff
Zhuang Liu, Yi Zhang, Xiaomeng Huang, Jian Li, Dong Wang, Mingqing Wang, Xing Huang

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueClimate variability and models
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesPolit National Laboratory for Marine Science and TechnologyNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésComputer scienceParallel computingStencilPolygon meshMassively parallelBottleneckPartition (number theory)Computational scienceSearch engine indexingSupercomputerDistributed computingMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract. This paper describes the development and performance optimization of a parallel computing infrastructure for an unstructured-mesh global model (GRIST; Global-to-Regional Integrated forecast SysTem). The focus is on three major aspects that facilitate rapid iterative development, including parallel computing, index optimization and an efficient group I/O strategy. For parallel computing, the METIS tool is used for the partition of the global mesh, which is flexible and convenient for both the quasi-uniform and variable-resolution simulations. The scaling tests show that the partition method is efficient. To improve the cache efficiency, several mesh index reordering strategies are investigated to optimize the performance of the indirect addressing scheme used in the stencil calculations. The numerical results show that the indexing strategies are able to speed up the calculations, especially for running with a small number of processes. To overcome the bottleneck of poor I/O efficiency for the high-resolution or massively parallel simulations, a group parallel I/O method is implemented and proven to be of high efficiency in the numerical experiments. Altogether, these three aspects of the parallel computing toolkits are encapsulated in a few interfaces, which can be used for general parallel modelling on unstructured meshes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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