Placental Epigenome-Wide Association Study Identified Loci Associated with Childhood Adiposity at 3 Years of Age
Notice bibliographique
Résumé
The aim of this study was to identify placental DNA methylation (DNAm) variations associated with adiposity at 3 years of age. We quantified placental DNAm using the Infinium MethylationEPIC BeadChips. We assessed associations between DNAm at single-CpGs and skinfold thickness using robust linear regression models adjusted for gestational age, child’s sex, age at follow-up and cellular heterogeneity. We sought replication of DNAm association with child adiposity in an independent cohort. We quantified placental mRNA levels for annotated gene using qRT-PCR and tested for correlation with DNAm. Lower DNAm at cg22593959 and cg22436429 was associated with higher adiposity (β = −1.18, q = 0.002 and β = −0.82, q = 0.04). The cg22593959 is located in an intergenic region (chr7q31.3), whereas cg22436429 is within the TFAP2E gene (1p34.3). DNAm at cg22593959 and cg22436429 was correlated with mRNA levels at FAM3C (rs = −0.279, p = 0.005) and TFAP2E (rs = 0.216, p = 0.03). In an independent cohort, the association between placental DNAm at cg22593959 and childhood adiposity was of similar strength and direction (β = −3.8 ± 4.1, p = 0.36), yet non-significant. Four genomic regions were also associated with skinfold thickness within FMN1, MAGI2, SKAP2 and BMPR1B genes. We identified placental epigenetic variations associated with adiposity at 3 years of age suggesting that childhood fat accretion patterns might be established during fetal life.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».