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Enregistrement W3090701129 · doi:10.12688/gatesopenres.13155.2

Metabolic gestational age assessment in low resource settings: a validation protocol

2021· preprint· en· W3090701129 sur OpenAlexaffabout
A. Brianne Bota, Victoria Ward, Stephen Hawken, Lindsay A. Wilson, Monica Lamoureux, Robin Ducharme, Malia S. Q. Murphy, Kathryn M. Denize, Matthew Henderson, Samir K. Saha, Salma Akther, Nancy A. Otieno, Stephen Munga, Raphael Atito, Jeffrey S. A. Stringer, Humphrey Mwape, Joan T. Price, Hilda Mujuru, Gwendoline Chimhini, Thulani Magwali, Louisa Mudawarima, Pranesh Chakraborty, Gary L. Darmstadt, Kumanan Wilson

Notice bibliographique

RevueGates Open Research · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBirth, Development, and Health
Établissements canadiensBruyèreUniversity of OttawaNewborn Screening OntarioChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésGestational ageMedicinePopulationBirth weightLow birth weightPediatricsNewborn screeningEstimationObstetricsPregnancyEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Preterm birth is the leading global cause of neonatal morbidity and mortality. Reliable gestational age estimates are useful for quantifying population burdens of preterm birth and informing allocation of resources to address the problem. However, evaluating gestational age in low-resource settings can be challenging, particularly in places where access to ultrasound is limited. Our group has developed an algorithm using newborn screening analyte values derived from dried blood spots from newborns born in Ontario, Canada for estimating gestational age within one to two weeks. The primary objective of this study is to validate a program that derives gestational age estimates from dried blood spot samples (heel-prick or cord blood) collected from health and demographic surveillance sites and population representative health facilities in low-resource settings in Zambia, Kenya, Bangladesh and Zimbabwe. We will also pilot the use of an algorithm to identify birth percentiles based on gestational age estimates and weight to identify small for gestational age infants. Once collected from local sites, samples will be tested by the Newborn Screening Ontario laboratory at the Children's Hospital of Eastern Ontario (CHEO) in Ottawa, Canada. Analyte values will be obtained through laboratory analysis for estimation of gestational age as well as screening for other diseases routinely conducted at Ontario's newborn screening program. For select conditions, abnormal screening results will be reported back to the sites in real time to facilitate counseling and future clinical management. We will determine the accuracy of our existing algorithm for estimation of gestational age in these newborn samples. Results from this research hold the potential to create a feasible method to assess gestational age at birth in low- and middle-income countries where reliable estimation may be otherwise unavailable.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,041
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,047
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil0,219

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0410,047
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0220,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,160
Tête enseignante GPT0,507
Écart entre enseignants0,347 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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