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Enregistrement W3091167916 · doi:10.3389/fonc.2020.558162

Radiomic Features From Multi-Parameter MRI Combined With Clinical Parameters Predict Molecular Subgroups in Patients With Medulloblastoma

2020· article· en· W3091167916 sur OpenAlexfundno aff
Jing Yan, Lei Liu, Weiwei Wang, Yuanshen Zhao, Kay Ka‐Wai Li, Ke Li, Li Wang, Binke Yuan, Haiyang Geng, Shenghai Zhang, Zhen Liu, Wenchao Duan, Yunbo Zhan, Dongling Pei, Haibiao Zhao, Tao Sun, Chen Sun, Wenqing Wang, Xuanke Hong, Xiangxiang Wang, Yu Guo, Wencai Li, Jingliang Cheng, Xianzhi Liu, Ho‐Keung Ng, Zhicheng Li, Zhenyu Zhang

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHospital for Sick ChildrenNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésMedulloblastomaSonic hedgehogMagnetic resonance imagingCohortMedicineWnt signaling pathwayRandom forestInternal medicineOncologyMachine learningPathologyRadiologyComputer scienceBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The 2016 WHO Classification of Central Nervous System tumors has included four molecular subgroups under medulloblastoma (MB) as sonic hedgehog (SHH), wingless (WNT), Grade 3 and Group 4. We aimed to develop machine learning models for predicting MB molecular subgroups based on multi-parameter magnetic resonance imaging (MRI) radiomics, tumor locations and clinical factors. 122 MB patients were enrolled retrospectively. After selecting robust, nonredundant and relevant features from 5529 extracted radiomics features, a random forest model was constructed based on a training cohort (n = 92) and evaluated on a testing cohort (n = 30). By combining the radiographic features and clinical parameters, two combined prediction models were also built. The subgroup can be classified using an 11-feature radiomics model with a high area under curve (AUC) of 0.8264 for WNT and modest AUCs of 0.6683, 0.6004 and 0.6979 for SHH, Group 3 and Group 4 in testing cohort, respectively. Incorporating location and hydrocephalus into the radiomics model resulted in improved AUCs of 0.8403 and 0.8317 for WNT and SHH, respectively. After adding gender and age, the AUCs for WNT and SHH were further improved to 0.9097 and 0.8654, while the accuracies were 70% and 86.67% for Group 3 and Group 4, respectively. The prediction performance was excellent for WNT and SHH, while that for Group 3 and Group 4 needs further improvements. Machine learning algorithms offer potentials to non-invasively predict molecular subgroups of MB.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,081
Score d'incertitude au seuil0,931

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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