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Enregistrement W3091550837 · doi:10.1080/17460441.2020.1822815

Disentangling the fibrous microenvironment: designer culture models for improved drug discovery

2020· review· en· W3091550837 sur OpenAlexafffund
Carley Ort, Wontae Lee, Nikita Kalashnikov, Christopher Moraes

Notice bibliographique

RevueExpert Opinion on Drug Discovery · 2020
Typereview
Langueen
DomaineEngineering
Thématique3D Printing in Biomedical Research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Cancer Society
Mots-clésDrug discoveryFunction (biology)Computer science3D cell culturePipeline (software)Computational biologyBiochemical engineeringBiologyBioinformaticsCell cultureEngineeringCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Standard high-throughput screening (HTS) assays rarely identify clinically viable 'hits', likely because cells do not experience physiologically realistic culture conditions. The biophysical nature of the extracellular matrix has emerged as a critical driver of cell function and response and recreating these factors could be critically important in streamlining the drug discovery pipeline. AREAS COVERED: The authors review recent design strategies to understand and manipulate biophysical features of three-dimensional fibrous tissues. The effects of architectural parameters of the extracellular matrix and their resulting mechanical behaviors are deconstructed; and their individual and combined impact on cell behavior is examined. The authors then illustrate the potential impact of these physical features on designing next-generation platforms to identify drugs effective against breast cancer. EXPERT OPINION: Progression toward increased culture complexity must be balanced against the demanding technical requirements for high-throughput screening; and strategies to identify the minimal set of microenvironmental parameters needed to recreate disease-relevant responses must be specifically tailored to the disease stage and organ system being studied. Although challenging, this can be achieved through integrative and multidisciplinary technologies that span microfabrication, cell biology, and tissue engineering.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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