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Enregistrement W3091993752 · doi:10.3389/fgene.2020.536771

Soybean Endo-1,3-Beta-Glucanase (GmGLU) Interaction With Soybean mosaic virus-Encoded P3 Protein May Contribute to the Intercelluar Movement

2020· article· en· W3091993752 sur OpenAlexfundno aff
Feifei Shi, Ying Wang, Fang Zhang, Xingxing Yuan, Huatao Chen, Xuehao Chen, Xiaoyan Cui

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Genetics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJiangsu Agriculture Research SystemGovernment of Jiangsu ProvinceAgriculture and Agri-Food CanadaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésCalloseSoybean mosaic virusPotyvirusNicotiana benthamianaBiologyTurnip mosaic virusBimolecular fluorescence complementationTobacco etch virusVirologyPlant virusCell biologyVirusGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Soybean mosaic virus (SMV), a member of the Potyvirus genus, is a prevalent and devastating viral pathogen in soybean-growing regions worldwide. Potyviral cell-to-cell movement was shown to target plasmodesmata (PD) by CI with the help of P3N-PIPO in a ratio-dependent manner. Potyvirus-encoded P3 is reported to participate in virus replication, movements, and pathogenesis. This study provides evidence that the soybean (Glycine max) endo-1,3-beta-glucanase protein (designated as GmGLU) interacts with SMV-P3 by using a two-hybrid yeast system to screen a soybean cDNA library. A bimolecular fluorescence complementation assay further confirmed the interaction, which occurred on the cytomembrane in Nicotiana benthamiana cells. Subcellular localization experiment indicated that GmGLU localized in the cytomembrane and GmGLU with PD (plasmodesmata) marker co-localization at plasmodesmata site. The transient expression of GmGLU can promote the coupling of Turnip mosaic virus replication and cell-to-cell movement in N. benthamiana. Meanwhile, qRT-PCR experiment demonstrated that the expression of GmGLU increased under SMV infection, which involved in regulation of callose. Under SMV infection, Callose deposition at PD was observed obviously by staining with aniline blue, which raise a physical barrier restricting cell-to-cell movement of SMV. While overexpression the GmGLU into the leaves under SMV infection, the callose induced by SMV was degraded. When coexpression the GmGLU and SMV in Soybean leaves, callose was not found, whereas a large amount of callose deposition on soybean leaves which were only under SMV infection. The results show that GmGLU can degrade the callose induced by SMV infection and indicate that the interaction between the membrane protein SMV-P3 and GmGLU contributes to the potyvirus intercelluar movement, and GmGLU may be an essential host factor involvement in potyvirus infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,291
Score d'incertitude au seuil0,381

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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