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Enregistrement W3092071318 · doi:10.1101/2020.10.06.328989

Methyl-CpG binding domain protein 2 plays a causal role in breast cancer growth and metastasis

2020· preprint· en· W3092071318 sur OpenAlexafffund
Niaz Mahmood, Ani Arakelian, Moshe Szyf, Shafaat A. Rabbani

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - Santé
Mots-clésMammary tumorDNA methylationCancer researchMetastasisCarcinogenesisEpigeneticsCancerBreast cancerBiologyCirculating tumor cellMetastatic breast cancerTranscriptomeTumor progressionGeneGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Methyl-CpG-binding domain protein 2 (Mbd2), a reader of DNA-methylation, has been implicated in the progression of several types of malignancies, including breast cancer. To test whether Mbd2, which is overexpressed in human breast cancer samples and in MMTV-PyMT mammary pads, plays a causal role in mammary tumor growth and metastasis we depleted Mbd2 in transgenic MMTV-PyMT model of breast cancer by cross-breeding with Mbd2 knockout mice to generate heterozygous (PyMT; Mbd2 +/- ) and homozygous (PyMT; Mbd2 -/- ) animals. We found that Mbd2 depletion caused a gene dose-dependent delay in mammary tumor formation, reduced primary tumor burden, and lung metastasis at the experimental endpoint. In addition, animals from the PyMT; Mbd2 -/- group survived significantly longer compared to the wildtype (PyMT; Mbd2 +/+ ) and PyMT; Mbd2 +/- arms. Transcriptomic and proteomic analyses of the primary tumors obtained from PyMT; Mbd2 +/+ and PyMT; Mbd2 +/- groups revealed that Mbd2 depletion alters several key determinants of the molecular signaling networks related to tumorigenesis and metastasis, which thereby demonstrate that Mbd2 is regulating transcriptional programs critical for breast cancer. To our knowledge, this is the first study demonstrating a causal role for a DNA-methylation reader in breast cancer. Results from this study will provide the rationale for further development of first-in-class targeted epigenetic therapies against Mbd2 to inhibit the progression of breast and other common cancers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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