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Enregistrement W3092108817 · doi:10.3390/microorganisms8101543

Interrelationships of Fiber-Associated Anaerobic Fungi and Bacterial Communities in the Rumen of Bloated Cattle Grazing Alfalfa

2020· article· en· W3092108817 sur OpenAlex
Elnaz Azad, Kelsey Fehr, Hooman Derakhshani, Robert J. Forster, S. N. Acharya, Ehsan Khafipour, E. J. McGeough, Tim A. McAllister

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMicroorganisms · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueRuminant Nutrition and Digestive Physiology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaMcMaster UniversityUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesBeef Cattle Research Council
Mots-clésRumenBiologyMicroorganismMicrobiologyBacteriaBotanyFermentationFood science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Frothy bloat is major digestive disorder of cattle grazing alfalfa pastures. Among the many factors identified to contribute to the development of frothy bloat, the disruption of rumen microbiota appears to be of central importance. Anaerobic rumen fungi (ARF) play an important role in sequential breakdown and fermentation of plant polysaccharides and promote the physical disruption of plant cell walls. In the present study, we investigated the dynamics of ARF during the development of alfalfa-induced frothy bloat and in response to bloat preventive treatments. By sequencing the internal transcribed spacer (ITS1) region of metagenomic DNA from the solid fraction of rumen contents, we were able to identify eight distinct genera of ARF, including Neocallimastix, Caecomyces, Orpinomyces, Piromyces, Cyllamyces, Anaeromyces, Buwchfawromyces, and unclassified Neocallimastigaceae. Overall, transition of steers from a baseline hay diet to alfalfa pastures was associated with drastic changes in the composition of the fungal community, but the overall composition of ARF did not differ (p > 0.05) among bloated and non-bloated steers. A correlation network analysis of the proportion of ARF and ruminal bacterial communities identified hub fungal species that were negatively correlated with several bacterial species, suggesting the presence of inter-kingdom competition among these rumen microorganisms. Interestingly, the number of negative correlations among ARF and bacteria decreased with frothy bloat, indicating a potential disruption of normal microbial profiles within a bloated rumen ecosystem. A better understanding of fungal-bacterial interactions that differ among bloated and non-bloated rumen ecosystem could advance our understanding of the etiology of frothy bloat.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,875
Score d'incertitude au seuil0,280

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle