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Crystallographic and electrophilic fragment screening of the SARS-CoV-2 main protease

2020· article· en· 541 citations· W3092125766 sur OpenAlex· 10.1038/s41467-020-18709-w

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants
0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

COVID-19, caused by SARS-CoV-2, lacks effective therapeutics. Additionally, no antiviral drugs or vaccines were developed against the closely related coronavirus, SARS-CoV-1 or MERS-CoV, despite previous zoonotic outbreaks. To identify starting points for such therapeutics, we performed a large-scale screen of electrophile and non-covalent fragments through a combined mass spectrometry and X-ray approach against the SARS-CoV-2 main protease, one of two cysteine viral proteases essential for viral replication. Our crystallographic screen identified 71 hits that span the entire active site, as well as 3 hits at the dimer interface. These structures reveal routes to rapidly develop more potent inhibitors through merging of covalent and non-covalent fragment hits; one series of low-reactivity, tractable covalent fragments were progressed to discover improved binders. These combined hits offer unprecedented structural and reactivity information for on-going structure-based drug design against SARS-CoV-2 main protease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

La notice

Revue
Nature Communications
Thématique
Computational Drug Discovery Methods
Domaine
Computer Science
Établissements canadiens
Organismes subventionnaires
Helen and Martin Kimmel Center for Molecular Design, Weizmann Institute of ScienceNovartis PharmaMedical Research CouncilMinistero dello Sviluppo EconomicoAstex PharmaceuticalsHungarian Science FoundationDiamond Light SourceWellcome TrustEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsMerck KGaAFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloGenome CanadaPfizerAstraZenecaEli Lilly and CompanyOntario Ministry of Economic Development and InnovationIsrael Science FoundationCancer Research UKIsrael Cancer Research Fund
Mots-clés
ProteaseProteasesSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Covalent bondCoronavirus disease 2019 (COVID-19)ElectrophileChemistryVirologyComputational biologyCoronavirus2019-20 coronavirus outbreakDimerCombinatorial chemistryBiologyEnzymeBiochemistryMedicineOutbreak
Résumé présent dans OpenAlex
oui