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Enregistrement W3092157739 · doi:10.1016/j.jneumeth.2020.108961

EEG Integrated Platform Lossless (EEG-IP-L) pre-processing pipeline for objective signal quality assessment incorporating data annotation and blind source separation

2020· article· en· W3092157739 sur OpenAlexafffund
James A. Desjardins, Stefon van Noordt, Scott Huberty, Sidney J. Segalowitz, Mayada Elsabbagh

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroscience Methods · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueEEG and Brain-Computer Interfaces
Établissements canadiensBrock UniversityDouglas Mental Health University InstituteMcGill UniversityCompute CanadaMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesAzrieli FoundationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFondation Brain Canada
Mots-clésPipeline (software)ElectroencephalographyLossless compressionComputer scienceBlind signal separationAnnotationSignal processingSIGNAL (programming language)Pattern recognition (psychology)Quality (philosophy)Artificial intelligenceSpeech recognitionData compressionData miningDigital signal processingNeurosciencePsychologyComputer hardwareTelecommunications

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The methods available for pre-processing EEG data are rapidly evolving as researchers gain access to vast computational resources; however, the field currently lacks a set of standardized approaches for data characterization, efficient interactive quality control review procedures, and large-scale automated processing that is compatible with High Performance Computing (HPC) resources. NEW METHOD: In this paper we describe an infrastructure for the development of standardized procedures for semi and fully automated pre-processing of EEG data. Our pipeline incorporates several methods to isolate cortical signal from noise, maintain maximal information from raw recordings and provide comprehensive quality control and data visualization. In addition, batch processing procedures are integrated to scale up analyses for processing hundreds or thousands of data sets using HPC clusters. RESULTS: We demonstrate here that by using the EEG Integrated Platform Lossless (EEG-IP-L) pipeline's signal quality annotations, significant increase in data retention is achieved when applying subsequent post-processing ERP segment rejection procedures. Further, we demonstrate that the increase in data retention does not attenuate the ERP signal. CONCLUSIONS: The EEG-IP-L state provides the infrastructure for an integrated platform that includes long-term data storage, minimal data manipulation and maximal signal retention, and flexibility in post processing strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,069

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0210,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,282
Tête enseignante GPT0,500
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations70
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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