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Enregistrement W3092241409 · doi:10.1038/s42003-020-01288-3

Multidimensional analyses reveal modulation of adaptive and innate immune subsets by tuberculosis vaccines

2020· article· en· W3092241409 sur OpenAlexaff
Virginie Rozot, Elisa Nemes, Hennie Geldenhuys, Munyaradzi Musvosvi, Asma Toefy, Frances Rantangee, Lebohang Makhethe, Mzwandile Erasmus, Nicole Bilek, Simbarashe Mabwe, Greg Finak, William J. Fulp, Ann M. Ginsberg, David A. Hokey, Muki Shey, Sanjay Gurunathan, Carlos A. DiazGranados, Linda‐Gail Bekker, Mark Hatherill, Thomas J. Scriba, Charmaine Abrahams, Marcelene Aderiye, Hadn Africa, Deidre Albertyn, Fadia Alexander, Julia Amsterdam, Peter Andersen, Denis Arendsen, H. Bester, Elizabeth Beyers, Natasja Botes, Janelle Botes, Samentra Braaf, Roger A. Brooks, Yolundi Cloete, Alessandro Companie, Kristin Croucher, Ilse Davids, Guy de Bruyn, Bongani Diamond, Portia Dlakavu, Palesa Dolo, Sahlah Dubel, Cindy Elbring, Ruth D. Ellis, Margareth Erasmus, Terence Esterhuizen, Thomas G. Evans, Christine Fattore, Sebastian Gelderbloem, Diann Gempies, Sandra Goliath, Peggy Gomes, Yolande Gregg, Elizabeth Hamilton, Willem A. Hanekom, Johanna Hector, Roxanne Herling, Yulandi Herselman, Robert Hopkins, Jane Hughes, Devin J Hunt, Henry Issel, Helene Janosczyk, Lungisa Jaxa, Carolyn Jones, Jateel Kassiem, Sophie Keffers, Xoliswa Kelepu, Alana Keyser, Alexia Kieffer, Ingrid Kromann, Sandra Krüger, Maureen Lambrick, Bernard Landry, Phumzile Langata, Maria Lempicki, Marie-Christine Locas, Angelique Kany Kany Luabeya, Lauren Mactavie, Lydia Makunzi, Pamela Mangala, Clive Maqubela, Boitumelo Mosito, Angelique Mouton, Humphrey Mulenga, Mariana Mullins, Julia Noble, Onke Nombida, Dawn M. O’Dee, Amy O’Neil, Rose Ockhuis, Saleha Omarjee, Fajwa Opperman, Dhaval M. Patel, Christel Petersen, Abraham Pretorius, Debbie Pretorius, Michael Raine, Rodney Raphela, Maigan Ratangee, Christian Rauner, Susan Rossouw, Surita Roux, Kathryn Rutkowski, Robert Ryall, Elisma Schoeman, Constance Schreuder, Steven G. Self, Cashwin September, Justin Shenje, Barbara Shepherd, Heather Siefers, Eunice Sinandile, Danna Skea, Marcia Steyn, Jin Su, Sharon Egretta Sutton, Anne Swarts, Patrick Syntin, Michèle Tameris, Petrus Tyambetyu, Arrie van der Merwe, Elize van der Riet, Dorothy van der Vendt, Denise van der Westhuizen, Anja van der Westhuizen, Elma van Rooyen, Ashley Veldsman, Helen Veltdsman, Emerencia Vermeulen, Sindile Wiseman Matiwane, Noncedo Xoyana

Notice bibliographique

RevueCommunications Biology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune responses and vaccinations
Établissements canadiensSanofi (Canada)
Organismes subventionnairesSanofi PasteurInternational Society for Advancement of CytometryWellcome TrustStatens Serum InstitutDepartment for International DevelopmentSanofiBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésMycobacterium tuberculosisImmunologyTuberculosisImmune systemVaccinationBiologyInnate immune systemAcquired immune systemCytokineBCG vaccineAdjuvantVirologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract We characterize the breadth, function and phenotype of innate and adaptive cellular responses in a prevention of Mycobacterium tuberculosis infection trial. Responses are measured by whole blood intracellular cytokine staining at baseline and 70 days after vaccination with H4:IC31 (subunit vaccine containing Ag85B and TB10.4), Bacille Calmette-Guerin (BCG, a live attenuated vaccine) or placebo (n = ~30 per group). H4:IC31 vaccination induces Ag85B and TB10.4-specific CD4 T cells, and an unexpected NKT like subset, that expresses IFN-γ, TNF and/or IL-2. BCG revaccination increases frequencies of CD4 T cell subsets that either express Th1 cytokines or IL-22, and modestly increases IFNγ-producing NK cells. In vitro BCG re-stimulation also triggers responses by donor-unrestricted T cells, which may contribute to host responses against mycobacteria. BCG, which demonstrated efficacy against sustained Mycobacterium tuberculosis infection, modulates multiple immune cell subsets, in particular conventional Th1 and Th22 cells, which should be investigated in discovery studies of correlates of protection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,577
Score d'incertitude au seuil0,526

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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