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Enregistrement W3092254979 · doi:10.1371/journal.pone.0240355

Transcriptome sequencing and endogenous phytohormone analysis reveal new insights in CPPU controlling fruit development in kiwifruit (Actinidia chinensis)

2020· article· en· W3092254979 sur OpenAlexafffund
Lin Wu, Jianbin Lan, Xiaoxue Xiang, Haiyang Xiang, Jin Zhao, Sadia Khan, Yiqing Liu

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesChongqing Municipal Education CommissionUniversity of TorontoChongqing Science and Technology CommissionNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésActinidia chinensisAbscisic acidActinidiaActinidia deliciosaGibberellinGibberellic acidBiologyZeatinCytokininAuxinBotanyTranscriptomeCell biologyBiochemistryGene expressionGeneGermination

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Kiwifruit (Actinidia chinensis) is a rich nutritious fruit crop owing to a markedly higher content of vitamin C and minerals. To promote fruit set and to increase the yield of kiwifruit, forchlorfenuron (CPPU) has been widely applied. However, the molecular details regarding CPPU controlling kiwifruit development, especially at the fastest fruit growth stage, remain unknown. In the present study, we measured the effect of CPPU on developmental regulation in red-fleshed kiwifruit (Actinidia chinensis 'Hongyang'). Additionally, a cytological analysis was performed to clarify the precise changes in the cell structure of the CPPU-treated kiwifruits. Moreover, the concentration of endogenous phytohormones, including indoleacetic acid (IAA), zeatin (ZT), gibberellic acid 3 (GA3), and abscisic acid (ABA), were measured by Enzyme-linked Immunosorbent Assay (ELISA). Furthermore, RNA-Seq was performed to dissect the complicated molecular mechanisms, with a focus on biosynthesis, metabolism, and signaling compounds, such as endogenous hormones, sugars, and L-ascorbic acid. Our results demonstrated that CPPU treatment not only regulates the size and weight of a single fruit but also improves the quality in 'Hongyang' kiwifruit through the accumulation of both soluble sugar and vitamin C. It was also seen that CPPU regulates kiwifruit development by enhancing cell expansion of epidermal cells and parenchyma cells, while, promoting cell division of subepidermal cells. Additionally, CPPU significantly increased the gibberellin and cytokinin biosynthetic pathway and signaling, while repressing auxin and ABA biosynthetic pathway; thus, signaling plays an essential role in CPPU controlling kiwifruit development. Notably, transcriptomic analysis revealed that a total of 2244 genes, including 352 unannotated genes, were differentially expressed in kiwifruits because of CPPU treatment, including 127 transcription factors. These genes are mainly enriched in plant hormone signal transduction, photosynthesis, MAPK signaling pathway, starch and sucrose metabolism, and phenylpropanoid biosynthesis. Overall, our results highlight that CPPU regulation of kiwifruit development is mainly associated with an antagonistic and/or synergistic regulatory role of endogenous phytohormones, and enhancing the energy supply. This provides new insights into the molecular details of CPPU controlling kiwifruit development at the fastest fruit growth stage, which is of agricultural importance for kiwifruit breeding and crop improvement.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,112
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,112 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2020
Routes d'admission2
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