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Enregistrement W3092288547 · doi:10.4315/jfp-20-328

Genomic Markers for Quaternary Ammonium Compound Resistance as a Persistence Indicator for Listeria monocytogenes Contamination in Food Manufacturing Environments

2020· article· en· W3092288547 sur OpenAlex
Ashley Cooper, Catherine D. Carrillo, Mylène Deschênes, Burton W. Blais

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Food Protection · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueListeria monocytogenes in Food Safety
Établissements canadiensCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésListeria monocytogenesBiologyBenzalkonium chlorideContaminationFood microbiologyMicrobiologyGenotypeGene cassetteAntibiotic resistanceBacteriaGeneGeneticsChemistryEcologyAntibioticsIntegron

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT: Persistent contamination of food manufacturing environments by Listeria monocytogenes is an important public health risk, because such contamination events defy standard sanitization protocols, for example, the application of quaternary ammonium compounds such as benzalkonium chloride (BC), providing a source for prolonged dissemination of the bacteria in food products. We performed whole genome sequencing analyses of 1,279 well-characterized L. monocytogenes isolates from various foods and food manufacturing environments and identified the bcrABC gene cassette associated with BC resistance in 531 (41.5%) isolates. The bcrABC cassette was significantly associated with L. monocytogenes isolates belonging to clonal complex (CC) 321, CC155, CC204, and CC199, which are among the 10 most prevalent genotypes recovered from foods and food production environments. All but 1 of the 177 CC321 isolates harbored the bcrABC cassette. In addition, 384 (38.6%) of the 994 isolates recovered from foods representing 67 different CCs and 119 (59.2%) of isolates from food manufacturing environmental samples representing 26 different CCs were found to harbor the intact bcrABC cassette. A representative set of 69 isolates with and without bcrABC was assayed for the ability to grow in the presence of BC, and 34 of 35 isolates harboring the bcrABC cassette exhibited MICs of ≥10 μg/mL BC. Determination of bcrABC in isolates could be achieved using both PCR and whole genome sequencing techniques, providing food testing laboratories with options for the characterization of isolates. The ability to determine markers of quaternary ammonium compound resistance such as bcrABC and epidemiologic lineage may provide risk managers with a tool to assess the potential for persistent contamination of the food manufacturing environment and the need for more targeted surveillance to ensure the efficacy of mitigation actions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,735

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,079
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle