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Enregistrement W3092298836 · doi:10.1186/s10020-020-00217-8

miRNA-23b as a biomarker of culture-positive neonatal sepsis

2020· article· en· W3092298836 sur OpenAlexfundno aff
Ahlam Fatmi, Sid Ahmed Rebiahi, Nafissa Chabni, Hanane Zerrouki, Hafsa Azzaoui, Yamina Elhabiri, Souheila Benmansour, José Santiago Ibáñez-Cabellos, Mohammed Smahi, Mourad Aribi, Jose Luis García‐Giménez, Federico V. Pallardó

Notice bibliographique

RevueMolecular Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeonatal and Maternal Infections
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesGrand Challenges Canada
Mots-clésSepsisNeonatal sepsisMedicineNeonatologyBlood cultureBiomarkerPositive correlationInternal medicineGastroenterologyBiologyAntibioticsPregnancy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Neonatal sepsis remains an important cause of morbidity and mortality. The ability to quickly and accurately diagnose neonatal sepsis based on clinical assessments and laboratory blood tests remains difficult, where haemoculture is the gold standard for detecting bacterial sepsis in blood culture. It is also very difficult to study because neonatal samples are lacking. METHODS: Forty-eight newborns suspected of sepsis admitted to the Neonatology Department of the Mother-Child Specialized Hospital of Tlemcen. From each newborn, a minimum of 1-2 ml of blood was drawn by standard sterile procedures for blood culture. The miRNA-23b level in haemoculture was evaluated by RT-qPCR. RESULTS: miR-23b levels increased in premature and full-term newborns in early onset sepsis (p < 0.001 and p < 0.005 respectively), but lowered in late onset sepsis in full-term neonates (p < 0.05) compared to the respective negative controls. miR-23b levels also increased in late sepsis in the negative versus early sepsis negative controls (p < 0.05). miR-23b levels significantly lowered in the newborns who died from both sepsis types (p < 0.0001 and p < 0.05 respectively). In early sepsis, miR-23b and death strongly and negatively correlated (correlation coefficient = - 0.96, p = 0.0019). In late sepsis, miRNA-23b and number of survivors (correlation coefficient = 0.70, p = 0.506) positively correlated. CONCLUSIONS: Lowering miR-23b levels is an important factor that favours sepsis development, which would confirm their vital protective role, and strongly suggest that they act as a good marker in molecular diagnosis and patient monitoring.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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