MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3092452096 · doi:10.1074/jbc.ra120.015533

Inhibition of the SUV4-20 H1 histone methyltransferase increases frataxin expression in Friedreich's ataxia patient cells

2020· article· en· W3092452096 sur OpenAlexaff
Gabriela Vilema-Enríquez, Robert Quinlan, Peter Kilfeather, Roberta Mazzone, Saba Saqlain, Irene del Molino del Barrio, Annalidia Donato, Gabriele Corda, Fengling Li, Masoud Vedadi, Andrea H. Németh, Paul E. Brennan, Richard Wade‐Martins

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensStructural Genomics ConsortiumUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilAlzheimer’s Research UKAction Medical ResearchAtaxia UKLifeArcWellcome Trust
Mots-clésFrataxinAtaxiaMethyltransferaseChemistryHistone methyltransferaseHistoneMolecular biologyCell biologyBiologyBiochemistryIron-binding proteinsMethylationGeneNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The molecular mechanisms of reduced frataxin ( FXN ) expression in Friedreich's ataxia (FRDA) are linked to epigenetic modification of the FXN locus caused by the disease-associated GAA expansion. Here, we identify that SUV4-20 histone methyltransferases, specifically SUV4-20 H1, play an important role in the regulation of FXN expression and represent a novel therapeutic target. Using a human FXN –GAA–Luciferase repeat expansion genomic DNA reporter model of FRDA, we screened the Structural Genomics Consortium epigenetic probe collection. We found that pharmacological inhibition of the SUV4-20 methyltransferases by the tool compound A-196 increased the expression of FXN by ∼1.5-fold in the reporter cell line. In several FRDA cell lines and patient-derived primary peripheral blood mononuclear cells, A-196 increased FXN expression by up to 2-fold, an effect not seen in WT cells. SUV4-20 inhibition was accompanied by a reduction in H4K20me2 and H4K20me3 and an increase in H4K20me1, but only modest (1.4–7.8%) perturbation in genome-wide expression was observed. Finally, based on the structural activity relationship and crystal structure of A-196, novel small molecule A-196 analogs were synthesized and shown to give a 20-fold increase in potency for increasing FXN expression. Overall, our results suggest that histone methylation is important in the regulation of FXN expression and highlight SUV4-20 H1 as a potential novel therapeutic target for FRDA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological Chemistry→Même sujetGenetic Neurodegenerative Diseases→Travaux en français237 207→