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Enregistrement W3092827404

Natural and Experimental Ophidiomycosis

2020· dissertation· en· W3092827404 sur OpenAlexaboutno aff
Christina McKenzie

Notice bibliographique

RevueThe Atrium (University of Guelph) · 2020
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueYeasts and Rust Fungi Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNatural (archaeology)Computer scienceGeography
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ophidiomycosis (snake fungal disease) is caused by the fungus Ophidiomyces ophiodiicola and is the most common cause of skin lesions in snakes in North America. Reports of this disease in the wild have been increasing over the past 10 years, including in Ontario. To better understand this disease, we examined naturally infected snakes (nine carcasses, 12 biopsies) submitted to the Canadian Wildlife Health Cooperative-Ontario/Nunavut node in 2012-2018. Affected species included the eastern foxsnake (Pantherophis vulpinus; n = 15), gray ratsnake (Pantherophis spiloides; n = 3), eastern massasauga (Sistrurus catenatus; n = 2) and queensnake (Regina septemvittata; n = 1). Lesion severity varied from incidental microscopic skin lesions to fatal, necrotizing, and ulcerative facial lesions. Although the dermal lesions of ophidiomycosis in free-ranging snakes are well described in numerous species, there are many knowledge gaps in our understanding of transmission, pathogenesis, morbidity and mortality, and the effects of brumation and temperature on disease development. We sought to fill some of these gaps by developing an experimental model using subcutaneous injection of O. ophiodiicola conidia in juvenile red cornsnakes (Patherophis guttatus). We then co-housed inoculated and non-inoculated snakes during brumation. Every inoculated snake developed gross and/or microscopic ophidiomycosis lesions. These consisted primarily of heterophilic and granulomatous inflammation with intralesional fungal hyphae in the dermis, subcutaneous tissue, and muscle. We also observed embolic fungal granulomas in 21/23 (91 %) inoculated snakes throughout the liver and within the coelomic connective tissue. Quantitative PCR for O. ophiodiicola was positive for 21 % of skin swabs, 37 % of exuvia and 100 % of liver samples for inoculated snakes. A single post brumation skin swab from a co-housed, non-inoculated snake tested positive using quantitative polymerase chain reaction. This snake had microscopic lesions consistent with ophidiomycosis, suggestive of horizontal transmission. Over the 70-day experiment, 87 % of inoculated snakes died of ophidiomycosis. No control snakes developed ophidiomycosis lesions or tested qPCR positive. Overall, our description of ophidiomycosis in Canadian free-ranging snakes combined with the knowledge gained from our experimental work offers insight into the pathogenesis and ecology of this important disease of free-ranging snakes in North America.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,545
Score d'incertitude au seuil0,415

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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