Age-dependent seroprevalence of dengue and chikungunya: inference from a cross-sectional analysis in Esmeraldas Province in coastal Ecuador
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: There are few population-based estimates for prevalence of past exposure to dengue and chikungunya viruses despite common epidemiological features. Here, we have developed a novel statistical method to study patterns of age-dependent prevalence of immunity in a population following exposures to two viruses which share similar epidemiological features including mode of transmission and induction of long-lasting immunity. This statistical technique accounted for sociodemographic characteristics associated with individuals and households. SETTINGS: The data consist of a representative sample from an ongoing longitudinal birth cohort set-up in a tropical district in coastal Ecuador (Esmeraldas). PARTICIPANTS: We collected data and blood samples from 319 individuals belonging to 152 households following epidemics of the infections in 2015 in Latin America. PRIMARY OUTCOME: Plasma was tested for the presence of specific IgG antibodies to dengue and chikungunya viruses by commercial ELISA and defined a bivariate binary outcome indicating individuals' past exposure status to dengue and chikungunya (ie, presence/absence of IgG antibodies to dengue or chikungunya or both). RESULTS: Dengue seroprevalence increased rapidly with age reaching 97% (95% credible interval (CrI): 93%-99%) by 60 years. Chikungunya seroprevalence peaked at 42% (95% CrI: 18%-66%) around 9 years of age and averaged 27% (95% CrI: 8.7%-51.6%) for all ages. Rural areas were more likely to be associated with dengue-only exposure while urban areas and shorter distance to the nearest household were associated with exposures to both. Women living in urban settings were more likely to be chikungunya seropositive while rural men were more likely to be dengue seropositive. CONCLUSION: Dengue seroprevalence was strongly age dependent consistent with endemic exposure while that of chikungunya peaked in childhood consistent with the recent emergence of the virus in the study area. Our findings will inform control strategies for the two arboviruses in Ecuador including recommendations by the WHO on dengue vaccination.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,010 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».