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Enregistrement W3092876137 · doi:10.1073/pnas.1920377117

MNK2 governs the macrophage antiinflammatory phenotype

2020· article· en· W3092876137 sur OpenAlexafffund
Margarita Bartish, Dongmei Tong, Yangxun Pan, Majken Wallerius, Hui Liu, Johannes Ristau, Sabrina de Souza Ferreira, Tatjana Wallmann, Vincent van Hoef, Laìa Masvidal, Thomas Kerzel, Anne-Laure Joly, Christophe Gonçalves, Samuel E.J. Preston, Talin Ebrahimian, Christina Seitz, Jonas Bergh, Kristian Pietras, Stéphanie Lehoux, Luigi Naldini, John Andersson, Mario Leonardo Squadrito, Sonia V. del Rincón, Ola Larsson, Charlotte Rolny

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchVetenskapsrådetKnut och Alice Wallenbergs StiftelseRadiumhemmets ForskningsfonderCancerfonden
Mots-clésEIF4EBiologyCell biologyPI3K/AKT/mTOR pathwayTranslation (biology)PhenotypeGene expressionImmune systemTumor microenvironmentCancer researchProinflammatory cytokineSignal transductionInflammationMessenger RNAGeneImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Significance The tumor-associated macrophage (TAM) phenotype is continuously modulated during tumor progression to facilitate immune escape. Yet, how gene expression programs control TAM phenotypes during this process is largely unknown. Here we show that, during acquisition of a protumor phenotype, gene expression in TAMs is predominantly modulated via selective changes in mRNA translation rather than changes in mRNA abundance. Detailed studies pinpointed augmented activity of MNK2, which phosphorylates eIF4E and thereby modulates mRNA translation, as required for the antiinflammatory macrophage phenotype. Accordingly, suppression of MNK2 reeducated antiinflammatory macrophages toward a proinflammatory phenotype with the ability to activate CD8 + T cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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