Organelle translocation and blue light inhibition of hyphal tip growth in the fungus Rhizopus arrhizus
Notice bibliographique
Résumé
In the 1990s I worked nutrient translocation in fungal mycelia. These works mainly used radioactive tracing to measure nutrient translocation. In parallel with that work I developed methods for studying the translocation of the large lipid bodies in the Zygomycete fungus Rhizopus arrhizus utilizing the then just available CCD cameras and video rate image analysis systems. None of these works became published at the time since I changed university and also changed area to some extent. Two works that are connected are now made available. They concern organelle translocation and blue light inhibition of hyphal tip growth. What is of main interest today is that organelles were found to travel along intracellular microtubular pathways. This is today well known but the sensitivity of this particular fungus to perturbation was extreme. A short opening of the Petri dish completely upset the orderly pattern of organelle translocation in the hyphae and replaced with a bulk flow that is what is normally observed for these coencytic fungi. Thus microscopy had to be performed with undisturbed hyphae inside the Petri avoiding opening the Petri for more than a few seconds. During that work it also became clear that lighting the hyphae for very short times with 450-490 nm blue light used to excite FITC or GFP for fluorescence microscopy quickly stopped organelle translocation. The other shot note investigate if such short light exposure also inhibit the hyphal tip growth rate and it does. Comment: These works were originally presented as a posters at Fifth International Mycological Congress, Vancouver, BC, Canada, August 14 - 21, 1994. They are now made available as a preprints. The Organelle translocation poster in its Manuscript version from 1998 version since colleagues have asked for the data. The Organelle translocation work was not published then since reviewers had problems accepting both digital images and image processing in Science since they still regarded photo and film as "objective and unbiased" observations. Using digital techniques to make things visible that the eyes cannot see was suspect. NOTE: These preprints can be cited but citation year should be 1995 for the Blue Light work 1998 for the Organelle translocation work since the citations and the discussion has not been updated. Anyone thinking these works are worth publishing with peer review should feel free to help me update them. Contact me first and I will then make you first author for the submission if you are interested. Email: stefan@olssonstefan.com
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,004 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».