The Effect of HLA-B27 on Susceptibility and Severity of COVID-19
Notice bibliographique
Résumé
To the Editor: Although many genes have polymorphisms, major histocompatibility complex genes are the most polymorphic. Many assume that the diversity of HLA increases the likelihood that a species can survive pandemics. Indeed, evidence suggests that HLA-B27 is protective for HIV1, hepatitis C2, and possibly influenza3. We recently reported results of a Web-based survey involving patients with spondyloarthritis (SpA)4. We now report an additional analysis of these data obtained between April 10, 2020, and May 31, 2020, to determine if the genetic marker HLA-B27 influences the contracting of the coronavirus 2019 (COVID-19) or the severity of COVID-19 infection. Subjects who participated in this research provided electronic consent as a first step in completing the survey. As it was a survey, it was not practical to obtain written, informed consent. Institutional review board approval was received from Oregon Health & Science University (IRB approval number: 00021375). Subjects (n = 3435) from 65 countries diagnosed with SpA completed the survey. Of these, 2836 or 82.6% were aware of their HLA-B27 status, with 76.1% being positive. Of those with known HLA-B27 status, 74.5% were from the United States and 8.0% were from Canada. The median age was 52 years. The group aware of B27 status included 1806 women, … Address correspondence to Dr. J.T. Rosenbaum, Oregon Health & Science University, 3181 SW Sam Jackson Pk Rd, Portland, OR 97239, USA. Email: rosenbaj{at}ohsu.edu.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,016 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».