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Enregistrement W3093157535 · doi:10.1101/2020.10.15.340620

Persistence of plant-mediated microbial soil legacy effects in soil and inside roots

2020· preprint· en· W3093157535 sur OpenAlexfundno aff
S. Emilia Hannula, Robin Heinen, Martine Huberty, Katja Steinauer, Jonathan R. De Long, Renske Jongen, Т. Martijn Bezemer

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycorrhizal Fungi and Plant Interactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesGénome QuébecNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekMcGill University
Mots-clésBiologyPlant communityPlant growthSoil waterColonizationPlant rootsPersistence (discontinuity)RhizosphereMicrobiomeAgronomyEcologyBotanyEcological successionBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Plant-soil feedbacks are shaped by microbial legacies previous plants leave in the soil. We tested the persistence of such soil legacies after subsequent colonization by the same or other plant species, and whether the microbiome created by the previous plant explains current plant growth. Legacies of previous plants were detectable in soil fungal communities several months after their removal while concomitantly the effect of the current plant amplified in time. Remarkably, bacterial legacies faded away rapidly in the soil and bacterial communities were selected strongly by plant currently growing in the soil. Both fungal and bacterial legacies wrought by the previous plant were conserved inside the root endophytic compartment of the current plant and these endophytes affected significantly the plant growth. Hence, microbial soil legacies present at the time of plant establishment play a vital role in shaping plant growth even as the composition gradually changes in the soil after subsequent plant colonization, as they are taken up as endophytes in the plant. This suggests that plant-soil feedbacks may be partly mediated by a relatively stable endophytic community acquired in early ontogeny while the effects of previous plants detected on soil microbiomes vary between organisms studied. We further show that plants growing in their own soils harbor different endophytic microbiomes than plants growing in soils with legacy of other plants and that especially grasses are sensitive to species specific fungal pathogens while all plant species have less endophytic Streptomycetes when growing in their own soil. In conclusion, we show that soil legacies wrought by previous plants can remain present in the soils and inside the roots for months, even when subsequent plants colonize the soil and that these legacies also substantially modulate the plant growth.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,185
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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