MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3093197380 · doi:10.1101/2020.10.14.339556

Cell size homeostasis is maintained by a circuitry involving a CDK4-determined target size that programs the cell size-dependent activation of p38

2020· preprint· en· W3093197380 sur OpenAlexafffund
Ceryl Tan, Miriam B. Ginzberg, Rachel Webster, Seshu Iyengar, Shixuan Liu, John Concannon, Yuan Wang, Douglas S. Auld, Jeremy L. Jenkins, Hannes Röst, Andreas Hilfinger, W. Brent Derry, Nish Patel, Ran Kafri

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Mots-clésCell sizemTORC1CellCell biologyCell growthBiologyCell cycleGenome sizeSignal transductionGeneticsGenomeGenePI3K/AKT/mTOR pathway

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY While molecules that promote the growth of animal cells have been identified, the following question remains: How are growth promoting pathways regulated to specify a characteristic size for each of the different cell types? In 1975, Hartwell and Nurse suggested that in eukaryotes, cell size is determined by size checkpoints – mechanisms that restrict cell cycle progression from cells that are smaller than their target size . Curiously, such checkpoint mechanisms imply a conceptual distinction between a cell’s actual size and cell’s target size. In the present study, we materialize this conceptual distinction by describing experimental assays that discriminately quantify a cell’s target size value. With these assays, we show that a cell’s size and target size are distinct phenotypes that are subject to different upstream regulators. While mTORC1 promotes growth in cell size, our data suggests that a cell’s target size value is regulated by other pathways including FGFR3, ROCK2, and CDK4. For example, while rapamycin (an mTORC1 inhibitor) decreases cell size, rapamycin does not change the target size that is required for the G1/S transition. The CDK4/Rb pathway has been previously proposed as a putative regulator of target size. Yet, in lacking experimental means that discriminate perturbations of cell growth from perturbations that reprogram target size, such claims on target size were not validated. To investigate the functions of CDK4 in target size determination, we used genetic and chemical means to ‘dial’ higher and lower levels of CDK4 activity. These measurements identified functions of CDK4 on target size that are distinct from other G1 CDKs. Using C. elegans , we further demonstrate that these influences of CDK4 on size determination function in vivo . Finally, we propose a model whereby mTORC1, p38, and CDK4 cooperate in a manner that is analogous to the function of a thermostat. While mTORC1 promotes cellular growth as prompted by p38, CDK4 is analogous to the thermostat dial that sets the critical target size associated with cell size homeostasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms→Travaux en français237 207→