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Enregistrement W3093317220 · doi:10.3389/fmolb.2020.583826

Enzyme Kinetics by Isothermal Titration Calorimetry: Allostery, Inhibition, and Dynamics

2020· review· en· W3093317220 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Molecular Biosciences · 2020
Typereview
Langueen
DomaineChemistry
Thématiquethermodynamics and calorimetric analyses
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University
Mots-clésIsothermal titration calorimetryKineticsChemistryAllosteric regulationEnzyme kineticsThermodynamicsIsothermal processTitrationMeasure (data warehouse)CalorimetryEnzymePhysical chemistryComputer scienceBiochemistryActive sitePhysicsData mining

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Isothermal titration calorimetry (ITC) involves accurately measuring the heat that is released or absorbed in real time when one solution is titrated into another. This technique is usually used to measure the thermodynamics of binding reactions. However, there is mounting interest in using it to measure reaction kinetics, particularly enzymatic catalysis. This application of ITC has been steadily growing for the past two decades, and the method is proving to be sensitive, generally applicable, and capable of providing information on enzyme activity that is difficult to obtain using traditional biochemical assays. This review aims to give a broad overview of the use of ITC to measure enzyme kinetics. It describes several different classes of ITC experiment, their strengths and weaknesses, and recent methodological advancements. A summary of applications in the literature is given and several examples where ITC has been used to investigate challenging aspects of enzyme behavior are presented in more detail. These include examples of allostery, where small-molecule binding outside the active site modulates activity. We describe the use of ITC to measure the strength, mode (i.e., competitive, uncompetitive, or mixed), and association and dissociation kinetics of enzyme inhibitors. Further, we provide examples of ITC applied to complex, heterogeneous mixtures, such as insoluble substrates and live cells. These studies exemplify the wide range of problems where ITC can provide answers, and illustrate the versatility of the technique and potential for future development and applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,990
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle