MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3093326078 · doi:10.1111/ctr.14110

The effect of human leukocyte antigen A1 and B35‐Cw4 on sustained BK polyomavirus DNAemia after renal transplantation

2020· article· en· W3093326078 sur OpenAlexaff
Seyed M. Hosseini‐Moghaddam, Qingyong Xu, Anthony M. Jevnikar, Andrew A. House, Patrick Luke, Aaron Campigotto, Jina J.Y. Kum, Gagandeep Singh, Hajed Obaid Alharbi, Mark Speechley

Notice bibliographique

RevueClinical Transplantation · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePolyomavirus and related diseases
Établissements canadiensLondon Health Sciences CentreUniversity of TorontoUniversity Health NetworkWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHuman leukocyte antigenMedicineImmunologyBK virusCytotoxic T cellTransplantationAntigenKidney transplantationVirologyInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human leukocyte antigen (HLA) class I presentation pathway plays a central role in natural killer (NK) cell and cytotoxic T-cell activities against BK polyomavirus (BKPyV) DNAemia. We determined the risk of sustained BKPyV DNAemia in 175 consecutive renal transplant recipients considering the simultaneous effect of donor/recipient HLA class I antigens and pre- or post-transplant variables. Median (IQR) age was 53 (44-64) years, and 37% of patients were female. 40 patients (22.9%) developed sustained BKPyV DNAemia [median (IQR) viral load: 9740 (4350-17 125) copies/ml]. In the Cox proportional hazard analysis, HLA-A1 (HR: 3.06, 95% CI: 1.51-6.17) and HLA-B35-Cw4 (HR: 4.63, 95% CI: 2.12-10.14) significantly increased the risk of sustained BKPyV DNAemia, while 2 HLA-C mismatches provided a marginally protective effect (HR: 0.32, 95% CI: 0.10-0.98). HLA-Cw4 is a ligand for NK cell inhibitory receptor, and HLA-B35 is in strong linkage disequilibrium with the HLA-Cw4 allele. The association between HLA-B35-Cw4 expression and sustained BKPyV DNAemia supports the important role of cytotoxic T cells and NK cells that would normally control BKPyV activation through engagement with immunoglobulin-like killer receptors (KIRs). Further studies are required to investigate the effect of HLA-C alleles along with NK cell activity against BKPyV DNAemia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,203
Score d'incertitude au seuil0,532

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,350
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueClinical TransplantationMême sujetPolyomavirus and related diseasesTravaux en français237 207