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A Comprehensive Subcellular Atlas of the Toxoplasma Proteome via hyperLOPIT Provides Spatial Context for Protein Functions

2020· article· en· 361 citations· W3093371308 sur OpenAlex· 10.1016/j.chom.2020.09.011

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants
0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

Apicomplexan parasites cause major human disease and food insecurity. They owe their considerable success to highly specialized cell compartments and structures. These adaptations drive their recognition, nondestructive penetration, and elaborate reengineering of the host's cells to promote their growth, dissemination, and the countering of host defenses. The evolution of unique apicomplexan cellular compartments is concomitant with vast proteomic novelty. Consequently, half of apicomplexan proteins are unique and uncharacterized. Here, we determine the steady-state subcellular location of thousands of proteins simultaneously within the globally prevalent apicomplexan parasite Toxoplasma gondii. This provides unprecedented comprehensive molecular definition of these unicellular eukaryotes and their specialized compartments, and these data reveal the spatial organizations of protein expression and function, adaptation to hosts, and the underlying evolutionary trajectories of these pathogens.

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La notice

Revue
Cell Host & Microbe
Thématique
Toxoplasma gondii Research Studies
Domaine
Immunology and Microbiology
Établissements canadiens
Organismes subventionnaires
Medical Research Council CanadaGE HealthcareWellcome TrustKing Abdullah University of Science and TechnologyLeverhulme TrustBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilThermo Fisher ScientificMedical Research CouncilWellcome
Mots-clés
BiologyProteomeContext (archaeology)Toxoplasma gondiiComputational biologyProtein subcellular localization predictionGolgi apparatusCell biologyEvolutionary biologyEndoplasmic reticulumGeneticsGene
Résumé présent dans OpenAlex
oui