Breeder demographic survey and molecular period prevalence of equid alphaherpesvirus 1 in Ontario
Notice bibliographique
Résumé
Equid alphaherpesvirus 1 (EHV-1) causes disease in all ages of horses, from abortion and neonatal death to encephalomyelopathy in adults. The main objective of this thesis was to investigate the current opinions of breeders in Ontario, provide prevalence estimates, and describe current vaccine use for EHV-1, which have not been studied. A survey of 88 breeders in Ontario indicated 72.7 % currently vaccinate their herds, and most consult veterinarians for assistance only when encountering abortions, not respiratory disease. Most herds were vaccinated either twice annually or using a "pre-foaling protocol". In a follow up study, a period prevalence estimate was generated by sampling 381 broodmares from 42 farms across Ontario every two months from December 2016 through October 2017. Samples were collected from the nose, blood and vaginal mucosa and analysed using droplet digital PCR (ddPCR). A total of 85.0 % of broodmares were positive for EHV-1 at some point during the sampling period, and vagina was identified as a source of EHV-1, with viral DNA collected more often from the vagina than the nose. Using mixed logistic regression models, we found no association between virus presence and age or breed. Nasal shedding occurred more often in pregnant mares, and vaccination was only associated with reduced virus in blood samples. When describing the virus neutralization titer response in this population, 32.3 % of mares did not respond to vaccination, and 48.5 % of all mares had no biologically significant changes in titers over the sampling period. Using IgG subisotyping, differing immune responses were observed depending on vaccine product most recently administered. There was no association between IgG subisotype and neutralizing virus titers, nor was there an association with serological titers and ddPCR positivity. Titers did generally increase with age and were typically highest in Standardbred and Thoroughbreds. In conclusion, although most respondents were concerned about EHV-1 enough to vaccinate, many did not, leaving the population at risk for outbreaks. Although vaccines were widely used, they were not consistent in their immune stimulation, potentially creating a false sense of security among breeders. Furthermore, most broodmares harbour the virus and shed intermittently.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».