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Enregistrement W3093515202 · doi:10.1016/j.talanta.2020.121802

Evaluation of ELISA-based method for total anabaenopeptins determination and comparative analysis with on-line SPE-UHPLC-HRMS in freshwater cyanobacterial blooms

2020· article· en· W3093515202 sur OpenAlexafffund
Audrey Roy‐Lachapelle, Morgan Solliec, Sébastien Sauvé, Christian Gagnon

Notice bibliographique

RevueTalanta · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAquatic Ecosystems and Phytoplankton Dynamics
Établissements canadiensUniversité de MontréalPolytechnique MontréalNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaEnvironment and Climate Change Canada
Organismes subventionnairesGénome QuébecGenome Canada
Mots-clésChemistryChromatographyCyanobacteriaMass spectrometryDetection limit

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Anabaenopeptins (APs) are bioactive cyanopeptides of emerging concern produced by cyanobacteria. The research for analytical development has recently gained in importance due to their abundance in toxic cyanobacterial blooms. A new commercial enzyme-linked immunosorbent assay kit for the determination of total APs (APtot ELISA) has been released promising a rapid response with good cost efficiency for the routine monitoring of uncommon cyanopeptides. The present study explores the suitability of this new kit in comparison with a validated quantitative analytical method based on liquid chromatography coupled to mass spectrometry (LC-MS). The validation results were comparable with both methods for accuracy, precision, and calibration. Method detection limits were more sensitive using LC-MS specifically evaluated at 0.011 and 0.013 μg L−1 for AP-A and B respectively, compared to APtot ELISA evaluated at 0.10 μg L−1 for total of the two. For APtot ELISA, results were independent from the matrix; however, a systematic signal response was measured in blanks, requiring a blank subtraction in data treatment. Cross-reactivity of APtot ELISA was investigated by analyzing ten cyanopeptides selected for their abundance and diversity. Cyanopeptolin A (CP-A), nodularin-R (NOD), microcystin (MC)-RR, [Asp3]RR, and HilR showed cross-reactivity with an average overestimation going from 25 to 66%. Considering the contribution of cross-reactive cyanopeptides, thirteen lake samples out of fifteen showed higher concentrations using APtot ELISA with overestimation values up to 2261% compared to LC-MS. In light of this study results, LC-MS should still be preconized for the study and monitoring of APs when sensitivity and specificity are needed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,224
Score d'incertitude au seuil0,591

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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