S3196 Dysbiosis in a Triplet With an Autism Spectrum Disorder: A Case Study
Notice bibliographique
Résumé
INTRODUCTION: We present a case of triplets, one diagnosed with an Autism Spectrum Disorder (ASD). While patients with ASD are characterized by deficits in language and social interaction, these are often accompanied by gastrointestinal (GI) symptoms. Approximately half of a children with ASD have GI problems as well, and there appears to be a positive correlation in severity of GI symptoms and autistic severity. Trials of vancomycin and fecal microbiota transplant (FMT) have shown that altering the microbiome of the gut has success in improving both GI and ASD symptoms. The purpose of this study was to compare the microbiome of an autistic child with that of the child’s biological siblings and mother, in the hopes of elucidating perturbations possibly associated with ASD. METHODS: Next-generation sequencing was performed on fecal samples from a mother and her 3 siblings, two healthy and one with ASD (Sibling #3). Following stool collection, DNA was then extracted, quantitated, and normalized for downstream library fabrication utilizing shotgun methodology. Prepared and indexed libraries were subsequently pooled and sequenced on the Illumina NextSeq 550 System. Metagenomic readout data was analyzed for relative abundances of defined bacteria and overall microbiome diversity as measured by Shannon index. RESULTS: The ASD patient (Sibling #3) was found to possess lower Bifidobacteria and Prevotella to the patient’s healthy mother, and overall lower biodiversity as measured by the Shannon Index. Additionally, healthy Sibling #1 was found to have greater bacterial diversity than the mother, more Prevotella and Bifidobacter than Sibling #2. CONCLUSION: Our findings demonstrate the role of dysbiosis in ASD, and the utility of microbiome sequencing in order to draw conclusions regarding etiology and potential treatment modalities. Sequencing of the microbiome also presents potential insights in determining the optimal donor for a patient. As highlighted in Figure 1, Sibling #1 has greater microbial diversity and more Bifidobacterium than the mother, and more Prevotella than Sibling #2 and Sibling #3.Figure 1.: Comparative diversity of the gut microbiome of a patient with ASD (Sibling #3) and the patient’s biological siblings and mother.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».